54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2571 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  100 
 
 
1559 aa  3179    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  85.62 
 
 
716 aa  1224    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  30.37 
 
 
1055 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0056  hypothetical protein  29.77 
 
 
1750 aa  277  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.93 
 
 
3689 aa  236  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0449  hypothetical protein  28.14 
 
 
1096 aa  229  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.471029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2496  hypothetical protein  27.99 
 
 
1094 aa  226  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0459  transglutaminase domain-containing protein  27.21 
 
 
971 aa  225  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2669  hypothetical protein  50.49 
 
 
217 aa  204  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0544133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 
2294 aa  132  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2668  hypothetical protein  48.48 
 
 
123 aa  129  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00194257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  39.58 
 
 
471 aa  105  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  39.58 
 
 
613 aa  105  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  21.7 
 
 
1998 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  38.97 
 
 
333 aa  100  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  39.44 
 
 
615 aa  100  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  39.44 
 
 
615 aa  99.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  39.44 
 
 
615 aa  99.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  38.97 
 
 
566 aa  96.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  95.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  36.3 
 
 
450 aa  94.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  38.24 
 
 
561 aa  94.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  38.24 
 
 
401 aa  94  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  38.24 
 
 
251 aa  93.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  36.03 
 
 
334 aa  91.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  35.17 
 
 
408 aa  88.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  36.03 
 
 
558 aa  88.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  30.43 
 
 
2486 aa  84.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  31.39 
 
 
1568 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  33.1 
 
 
2286 aa  76.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  33.78 
 
 
701 aa  76.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 
3073 aa  75.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  33.9 
 
 
3273 aa  72.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  30.13 
 
 
6274 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  26.92 
 
 
2585 aa  62.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  28.65 
 
 
400 aa  62  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  26.06 
 
 
575 aa  61.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  26.06 
 
 
574 aa  61.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  26.06 
 
 
581 aa  61.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  29.41 
 
 
614 aa  58.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  28.7 
 
 
2290 aa  57.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.45 
 
 
1140 aa  57.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0456  hypothetical protein  32.8 
 
 
267 aa  56.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.509497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  26.39 
 
 
388 aa  55.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  26 
 
 
2387 aa  53.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  37.31 
 
 
209 aa  52.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  28.26 
 
 
2296 aa  52.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 
2615 aa  52.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0431  Hedgehog/intein hint domain protein  30.93 
 
 
1232 aa  52.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.940006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  26.54 
 
 
846 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  33.33 
 
 
1953 aa  50.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 
1391 aa  50.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  24.39 
 
 
2542 aa  47.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 
525 aa  46.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>