14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3992 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  100 
 
 		 1055 aa  2175    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  30.24 
 
 		 1559 aa  363  8e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0459  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 		 971 aa  296  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0449  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1096 aa  270  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.471029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2496  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1094 aa  269  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0056  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1750 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 3689 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  32.45 
 
 		 2294 aa  124  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  31.72 
 
 		 1998 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2669  hypothetical protein  31.31 
 
 		 217 aa  88.6  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0544133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2668  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00194257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0456  hypothetical protein  30.83 
 
 		 267 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.509497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  25.12 
 
 		 478 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  32.56 
 
 		 210 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>