35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11163 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  38.58 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  38.97 
 
 
217 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  38.97 
 
 
217 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  38.97 
 
 
217 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  39 
 
 
223 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  40.59 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  37.44 
 
 
220 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  35 
 
 
226 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  37.44 
 
 
234 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  33.51 
 
 
225 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  36 
 
 
239 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  36.36 
 
 
232 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  36.08 
 
 
235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  35.2 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  36.71 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  28.08 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  23.95 
 
 
242 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  26.87 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  25.87 
 
 
515 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  29.29 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  25.17 
 
 
515 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  27.04 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  32.56 
 
 
1055 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
510 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  27.45 
 
 
515 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  27.66 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  32.63 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  26.09 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  23.37 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  25.79 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  30.11 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  24.26 
 
 
265 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>