More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1310 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  100 
 
 		 2387 aa  4818    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  35.86 
 
 		 2350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  32.81 
 
 		 3073 aa  273  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  28.17 
 
 		 2831 aa  262  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1763 aa  260  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.05 
 
 		 2961 aa  254  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.85 
 
 		 1271 aa  163  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1352 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 2035 aa  124  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.32 
 
 		 2225 aa  121  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.39 
 
 		 2221 aa  119  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.28 
 
 		 1599 aa  118  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.15 
 
 		 765 aa  117  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1942 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1917 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.24 
 
 		 1464 aa  112  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.59 
 
 		 2246 aa  112  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.3 
 
 		 2178 aa  112  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  28.99 
 
 		 1732 aa  109  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.97 
 
 		 1384 aa  107  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.04 
 
 		 1840 aa  107  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1669 aa  105  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  22.59 
 
 		 2224 aa  104  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.28 
 
 		 678 aa  104  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.53 
 
 		 738 aa  104  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  22.27 
 
 		 2224 aa  103  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.52 
 
 		 2658 aa  104  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.17 
 
 		 2096 aa  104  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  22.27 
 
 		 2224 aa  103  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.27 
 
 		 2003 aa  102  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  28.3 
 
 		 504 aa  102  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.07 
 
 		 1381 aa  102  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.16 
 
 		 1485 aa  99.8  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1600 aa  99  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.74 
 
 		 788 aa  97.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.74 
 
 		 788 aa  97.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  31.65 
 
 		 382 aa  97.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.32 
 
 		 2349 aa  97.1  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 927 aa  96.3  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 690 aa  95.9  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  30.98 
 
 		 741 aa  95.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  28.42 
 
 		 400 aa  95.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  31.65 
 
 		 396 aa  95.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  30.82 
 
 		 764 aa  93.6  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.64 
 
 		 3027 aa  92.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.52 
 
 		 2277 aa  91.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 869 aa  90.1  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  26.56 
 
 		 765 aa  90.1  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.96 
 
 		 1959 aa  90.1  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 2294 aa  89.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1433 aa  88.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.19 
 
 		 705 aa  87.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 3273 aa  87.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.62 
 
 		 2149 aa  87  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  27.07 
 
 		 1998 aa  86.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1531 aa  86.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.1 
 
 		 1485 aa  86.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.84 
 
 		 1518 aa  85.9  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1935 aa  84  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.45 
 
 		 1576 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1147 aa  83.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 		 3193 aa  83.2  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24.45 
 
 		 605 aa  83.2  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1090 aa  82  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.82 
 
 		 2017 aa  81.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 2942 aa  81.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.35 
 
 		 1572 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1517 aa  79.7  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  31.94 
 
 		 1620 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  22.92 
 
 		 1259 aa  77.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.63 
 
 		 1586 aa  77.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.63 
 
 		 1595 aa  77.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.26 
 
 		 1446 aa  77  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1081 aa  76.3  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  24.67 
 
 		 1008 aa  75.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  24.67 
 
 		 1008 aa  75.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.34 
 
 		 1488 aa  75.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  24.85 
 
 		 840 aa  75.5  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  22.99 
 
 		 1150 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  30.88 
 
 		 423 aa  75.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  25.4 
 
 		 2585 aa  74.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 1623 aa  75.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 909 aa  75.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1150 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  24.69 
 
 		 1345 aa  74.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  22.96 
 
 		 2731 aa  73.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  24.69 
 
 		 1345 aa  74.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  22.88 
 
 		 1150 aa  73.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  22.58 
 
 		 931 aa  73.2  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1494 aa  73.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1418 aa  73.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  33.8 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1405 aa  73.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1390 aa  73.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1149 aa  72.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  37.5 
 
 		 1626 aa  72.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1687 aa  72  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.49 
 
 		 1517 aa  72  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4284  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1687 aa  72  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1400 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>