More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0467 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1081 aa  2165    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  59.58 
 
 		 1090 aa  1090    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  28.52 
 
 		 1046 aa  279  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  29.45 
 
 		 1053 aa  274  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0461  hypothetical protein  45.1 
 
 		 335 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0550452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.91 
 
 		 2096 aa  171  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1352 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1023 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1600 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1959 aa  149  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1840 aa  148  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.34 
 
 		 2035 aa  144  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 2294 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1271 aa  140  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.11 
 
 		 2149 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.68 
 
 		 2225 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.68 
 
 		 2246 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1953 aa  128  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1917 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.45 
 
 		 1467 aa  126  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1942 aa  124  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 3073 aa  122  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 927 aa  121  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.81 
 
 		 1732 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.27 
 
 		 1464 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.83 
 
 		 678 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.77 
 
 		 2277 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.19 
 
 		 2178 aa  119  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.14 
 
 		 1576 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1669 aa  118  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.1 
 
 		 2221 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.5 
 
 		 2224 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.5 
 
 		 2224 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.31 
 
 		 765 aa  115  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 		 690 aa  115  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.38 
 
 		 3027 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.36 
 
 		 2224 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1520 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.46 
 
 		 1509 aa  111  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.95 
 
 		 1599 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.91 
 
 		 1345 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.91 
 
 		 1345 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.99 
 
 		 1008 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.99 
 
 		 1008 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.65 
 
 		 1572 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.48 
 
 		 1551 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.85 
 
 		 1528 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1527 aa  106  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.73 
 
 		 1485 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 2003 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  21.63 
 
 		 1550 aa  104  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 3193 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  29.67 
 
 		 504 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22 
 
 		 1560 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.32 
 
 		 1381 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  29.34 
 
 		 902 aa  101  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.7 
 
 		 1488 aa  101  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1147 aa  101  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1611 aa  101  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  21.28 
 
 		 1547 aa  99  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.39 
 
 		 2731 aa  99  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  22.06 
 
 		 1568 aa  98.2  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 3273 aa  97.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 913 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  27.29 
 
 		 2017 aa  93.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.14 
 
 		 1485 aa  92.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 2486 aa  92.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  24.82 
 
 		 765 aa  92  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 2942 aa  91.3  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  30.79 
 
 		 2762 aa  91.3  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  28.78 
 
 		 396 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1628 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  22.41 
 
 		 924 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  25.12 
 
 		 2658 aa  90.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  23.92 
 
 		 1348 aa  89.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  23.87 
 
 		 1626 aa  89.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1433 aa  89.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1409 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.52 
 
 		 1586 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.79 
 
 		 1595 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.96 
 
 		 482 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  33.71 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  26.84 
 
 		 2387 aa  86.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  21.81 
 
 		 1384 aa  85.9  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  27.41 
 
 		 6272 aa  85.9  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.95 
 
 		 2094 aa  85.1  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1531 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  29.22 
 
 		 400 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2145 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1411 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.62 
 
 		 2350 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.68 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.68 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  22.67 
 
 		 1427 aa  83.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1558 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.42 
 
 		 1976 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1834 aa  82  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.76 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  24.92 
 
 		 738 aa  82  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>