More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4802 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  100 
 
 		 2017 aa  4117    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  35.37 
 
 		 2138 aa  983    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1834 aa  310  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  31.12 
 
 		 1517 aa  286  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.17 
 
 		 2117 aa  257  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  27.29 
 
 		 2513 aa  208  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.62 
 
 		 2094 aa  199  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.22 
 
 		 1976 aa  194  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.84 
 
 		 1352 aa  192  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2096 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 3320 aa  172  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.05 
 
 		 2076 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.6 
 
 		 482 aa  169  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  44.09 
 
 		 474 aa  167  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.67 
 
 		 3456 aa  166  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3333 aa  164  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1126 aa  162  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  32.95 
 
 		 628 aa  159  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 2007 aa  158  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.82 
 
 		 2145 aa  158  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.6 
 
 		 2413 aa  157  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1488 aa  154  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  24.44 
 
 		 2416 aa  153  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 927 aa  152  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.22 
 
 		 1271 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 2437 aa  148  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 690 aa  147  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 2401 aa  147  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1600 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  27.32 
 
 		 2035 aa  142  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 2494 aa  142  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1433 aa  142  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  27.15 
 
 		 2059 aa  140  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1140 aa  137  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 2283 aa  135  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1953 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 2031 aa  134  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.59 
 
 		 2031 aa  133  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.08 
 
 		 2497 aa  133  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.32 
 
 		 764 aa  133  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 2032 aa  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.05 
 
 		 1381 aa  133  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  26.02 
 
 		 2290 aa  132  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  26.48 
 
 		 2191 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 2448 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 3193 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25 
 
 		 1577 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  27.5 
 
 		 788 aa  129  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  27.5 
 
 		 788 aa  129  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1825 aa  128  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1806 aa  128  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 3073 aa  126  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.52 
 
 		 705 aa  125  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  28.08 
 
 		 2003 aa  125  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2428 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  24.09 
 
 		 2762 aa  125  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1825 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 605 aa  124  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.05 
 
 		 1595 aa  123  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 2402 aa  123  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  23.19 
 
 		 1560 aa  123  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.97 
 
 		 2035 aa  123  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  27.41 
 
 		 1427 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1628 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.36 
 
 		 2149 aa  122  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.82 
 
 		 1586 aa  122  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  44.14 
 
 		 554 aa  122  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.68 
 
 		 1599 aa  122  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 2031 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1487 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 2286 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1732 aa  120  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.6 
 
 		 1467 aa  120  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.93 
 
 		 741 aa  119  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.66 
 
 		 917 aa  116  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  24.05 
 
 		 920 aa  116  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.59 
 
 		 2225 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.58 
 
 		 1489 aa  115  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  23.97 
 
 		 2194 aa  113  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1854 aa  113  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.92 
 
 		 3027 aa  112  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.52 
 
 		 869 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 3273 aa  112  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.61 
 
 		 903 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 913 aa  111  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.24 
 
 		 1485 aa  110  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  26.15 
 
 		 2178 aa  111  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.35 
 
 		 2246 aa  110  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.07 
 
 		 1494 aa  110  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.61 
 
 		 889 aa  110  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1494 aa  110  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1669 aa  109  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.26 
 
 		 1140 aa  109  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.65 
 
 		 1517 aa  107  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.99 
 
 		 2224 aa  107  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 3689 aa  107  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.99 
 
 		 2224 aa  107  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.52 
 
 		 2224 aa  107  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  25.09 
 
 		 940 aa  107  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 2374 aa  107  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>