More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0468 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  61.38 
 
 		 1081 aa  1128    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1090 aa  2176    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0461  hypothetical protein  77.47 
 
 		 335 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0550452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  30.36 
 
 		 1053 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  29.15 
 
 		 1046 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1352 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2096 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1600 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.57 
 
 		 1271 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1023 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 2035 aa  159  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.29 
 
 		 1467 aa  149  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  28.14 
 
 		 1953 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.03 
 
 		 2149 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.57 
 
 		 3027 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 927 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.52 
 
 		 2225 aa  132  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 2294 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.55 
 
 		 678 aa  131  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.53 
 
 		 1509 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1942 aa  128  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.03 
 
 		 2277 aa  128  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1917 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.04 
 
 		 1485 aa  127  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.5 
 
 		 2731 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.17 
 
 		 1576 aa  127  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1840 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.58 
 
 		 1626 aa  125  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.22 
 
 		 1599 aa  124  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 3193 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.79 
 
 		 2246 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.83 
 
 		 690 aa  118  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2003 aa  118  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1669 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.68 
 
 		 1008 aa  116  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.4 
 
 		 1488 aa  116  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.3 
 
 		 1560 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.68 
 
 		 1008 aa  116  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1551 aa  116  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1527 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.35 
 
 		 2221 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.32 
 
 		 765 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.72 
 
 		 2178 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1550 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.44 
 
 		 1528 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1147 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.45 
 
 		 1345 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.45 
 
 		 1345 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  26.46 
 
 		 2224 aa  111  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  26.46 
 
 		 2224 aa  111  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.54 
 
 		 1381 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1433 aa  111  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1959 aa  110  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.42 
 
 		 2224 aa  110  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1197 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  27.38 
 
 		 2017 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.17 
 
 		 1464 aa  108  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.91 
 
 		 1572 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.79 
 
 		 1259 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  21.95 
 
 		 1547 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.47 
 
 		 2942 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 3273 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1611 aa  106  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.69 
 
 		 1577 aa  105  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1520 aa  105  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  25.54 
 
 		 2387 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.05 
 
 		 1595 aa  104  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  27.16 
 
 		 1732 aa  104  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.11 
 
 		 1586 aa  104  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1531 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 2486 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 2374 aa  101  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.11 
 
 		 2350 aa  101  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  21.07 
 
 		 1384 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1487 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.62 
 
 		 1485 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 3073 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.93 
 
 		 1518 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 3689 aa  99.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1834 aa  99  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  27.71 
 
 		 1998 aa  99  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.66 
 
 		 1362 aa  99  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1623 aa  99  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1602 aa  97.8  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 605 aa  97.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  27.39 
 
 		 788 aa  96.3  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  27.39 
 
 		 788 aa  96.3  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1390 aa  96.3  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.27 
 
 		 1609 aa  95.9  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.78 
 
 		 1489 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  28.03 
 
 		 902 aa  95.1  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.13 
 
 		 1494 aa  94.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1494 aa  94.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  22.36 
 
 		 1573 aa  94  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.79 
 
 		 903 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  27.83 
 
 		 2762 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1405 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  27.95 
 
 		 6272 aa  92.8  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  24.55 
 
 		 1427 aa  92.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.46 
 
 		 482 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>