225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3020 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 2762 aa  5672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  31.71 
 
 		 2513 aa  1004    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  25.69 
 
 		 2413 aa  404  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  30.97 
 
 		 2497 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  30.69 
 
 		 2428 aa  253  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  33 
 
 		 722 aa  221  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 3333 aa  212  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  28.93 
 
 		 2448 aa  207  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 2401 aa  202  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 2437 aa  202  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  27.89 
 
 		 2283 aa  201  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 2402 aa  198  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  33.82 
 
 		 2416 aa  189  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1854 aa  172  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  26.26 
 
 		 2075 aa  171  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2165 aa  158  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.28 
 
 		 2094 aa  153  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1834 aa  138  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  33.24 
 
 		 622 aa  132  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.88 
 
 		 2017 aa  123  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  29.05 
 
 		 474 aa  112  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.57 
 
 		 482 aa  112  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.33 
 
 		 2096 aa  111  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  32.52 
 
 		 583 aa  111  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.8 
 
 		 2138 aa  101  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  34.27 
 
 		 554 aa  100  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  39.67 
 
 		 2494 aa  93.2  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 2286 aa  92  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.41 
 
 		 1953 aa  91.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 955 aa  92  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1352 aa  87.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.97 
 
 		 2145 aa  84.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 628 aa  85.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 920 aa  84.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1840 aa  84.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3614  Ham1-like protein  48.08 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1517 aa  83.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 939 aa  81.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  23.85 
 
 		 940 aa  81.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.04 
 
 		 2149 aa  80.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1081 aa  80.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0136  hypothetical protein  45.63 
 
 		 321 aa  79.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 881 aa  78.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1090 aa  78.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  63.27 
 
 		 340 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  24.75 
 
 		 2035 aa  77  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  22.73 
 
 		 1976 aa  77  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1942 aa  77.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 869 aa  75.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  24.75 
 
 		 2059 aa  75.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.79 
 
 		 2731 aa  74.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  23.52 
 
 		 3073 aa  74.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  24.59 
 
 		 886 aa  73.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  21.94 
 
 		 927 aa  73.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1917 aa  73.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.18 
 
 		 2117 aa  72.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.19 
 
 		 1669 aa  72.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.37 
 
 		 1600 aa  72  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  22.63 
 
 		 1485 aa  71.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 2942 aa  71.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  24.73 
 
 		 1579 aa  70.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  24.84 
 
 		 1140 aa  70.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.73 
 
 		 1428 aa  69.7  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.63 
 
 		 1599 aa  68.6  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.92 
 
 		 2032 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.37 
 
 		 678 aa  67.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  21.52 
 
 		 1271 aa  67  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 2031 aa  66.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  37.17 
 
 		 232 aa  66.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.18 
 
 		 2277 aa  66.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.86 
 
 		 3027 aa  66.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  23.75 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  24.7 
 
 		 2031 aa  66.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 2031 aa  65.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.63 
 
 		 2658 aa  64.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  30.06 
 
 		 299 aa  64.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  21.53 
 
 		 1126 aa  64.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  22.73 
 
 		 2558 aa  64.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  22.4 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  28.81 
 
 		 2349 aa  63.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  22.8 
 
 		 1489 aa  63.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 2374 aa  63.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  26.54 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 2486 aa  63.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.03 
 
 		 3456 aa  63.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.84 
 
 		 2479 aa  62.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.31 
 
 		 1539 aa  62.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.7 
 
 		 2076 aa  62.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  25.06 
 
 		 2698 aa  62.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 3320 aa  61.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  22.72 
 
 		 2290 aa  61.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.47 
 
 		 1595 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  29.88 
 
 		 1008 aa  61.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  29.88 
 
 		 1008 aa  61.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.52 
 
 		 1959 aa  60.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1552 aa  60.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  22.98 
 
 		 1345 aa  60.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  22.98 
 
 		 1345 aa  60.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  24.69 
 
 		 1732 aa  60.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>