More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4370 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 869 aa  1769    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  33.83 
 
 		 1405 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  33.04 
 
 		 1998 aa  275  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1352 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  42.64 
 
 		 298 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  42.64 
 
 		 298 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  42.64 
 
 		 316 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1600 aa  163  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 2003 aa  150  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.89 
 
 		 2225 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29 
 
 		 2294 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1959 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1390 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  28.29 
 
 		 2246 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.3 
 
 		 1599 aa  138  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.18 
 
 		 2224 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.18 
 
 		 2224 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  28.77 
 
 		 2221 aa  137  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.31 
 
 		 2178 aa  135  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 3193 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.8 
 
 		 2224 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.08 
 
 		 765 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.93 
 
 		 1464 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.3 
 
 		 2096 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1517 aa  129  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  27.62 
 
 		 504 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.41 
 
 		 678 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1917 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1942 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1147 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 690 aa  121  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1008 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 		 927 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1008 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.9 
 
 		 1586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.18 
 
 		 1595 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  26.68 
 
 		 1160 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.32 
 
 		 1271 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1611 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.54 
 
 		 2149 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  28.4 
 
 		 2349 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  25.86 
 
 		 2658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.7 
 
 		 1572 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.5 
 
 		 1345 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.26 
 
 		 924 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.5 
 
 		 1345 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  30.55 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1669 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.47 
 
 		 1576 aa  111  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 423 aa  111  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.1 
 
 		 1381 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.04 
 
 		 1568 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.09 
 
 		 1976 aa  110  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 2831 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  24.58 
 
 		 738 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1433 aa  108  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1418 aa  107  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.7 
 
 		 1429 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  27.45 
 
 		 1732 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1834 aa  106  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.52 
 
 		 741 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  24.61 
 
 		 765 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.06 
 
 		 1614 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  24.96 
 
 		 705 aa  105  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2017 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.21 
 
 		 2350 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 2961 aa  104  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  31.49 
 
 		 382 aa  104  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1558 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  22.24 
 
 		 1390 aa  101  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1402 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 2374 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1410 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 2486 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  23.89 
 
 		 788 aa  98.2  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  23.89 
 
 		 788 aa  98.2  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  29.8 
 
 		 1681 aa  97.8  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.34 
 
 		 3027 aa  97.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 2942 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  24.91 
 
 		 764 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 913 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.81 
 
 		 1384 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.09 
 
 		 2076 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  24.03 
 
 		 840 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1763 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 909 aa  93.2  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1550 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.8 
 
 		 3456 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.09 
 
 		 1467 aa  92.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.3 
 
 		 1485 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.04 
 
 		 1560 aa  91.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  28.35 
 
 		 1710 aa  90.9  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  25.9 
 
 		 2387 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.9 
 
 		 2277 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 2035 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  32.59 
 
 		 396 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.18 
 
 		 903 aa  89  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  21.26 
 
 		 1379 aa  88.2  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>