More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1703 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  100 
 
 		 2094 aa  4304    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  29.82 
 
 		 1517 aa  330  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1834 aa  289  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28 
 
 		 1328 aa  268  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.17 
 
 		 2117 aa  206  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  27.51 
 
 		 2017 aa  197  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2138 aa  181  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1488 aa  167  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 		 628 aa  164  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.3 
 
 		 1271 aa  165  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 3320 aa  162  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  24.37 
 
 		 2762 aa  161  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.97 
 
 		 2145 aa  160  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  23.91 
 
 		 2513 aa  159  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.34 
 
 		 1976 aa  159  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.41 
 
 		 2096 aa  155  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.87 
 
 		 1140 aa  149  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.98 
 
 		 2497 aa  149  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 927 aa  149  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1126 aa  146  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25.5 
 
 		 2290 aa  144  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  22.92 
 
 		 2448 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.05 
 
 		 2413 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.02 
 
 		 690 aa  143  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1140 aa  142  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.8 
 
 		 2076 aa  142  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 3333 aa  141  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  25.34 
 
 		 2428 aa  138  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  30.62 
 
 		 2286 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1352 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.05 
 
 		 2149 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.8 
 
 		 1485 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 2437 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 2942 aa  131  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  25.64 
 
 		 2075 aa  128  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  27.16 
 
 		 738 aa  128  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1433 aa  128  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.09 
 
 		 3456 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.21 
 
 		 903 aa  126  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  28.24 
 
 		 2416 aa  125  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 		 2402 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 2283 aa  124  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 2401 aa  122  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  25.5 
 
 		 2165 aa  122  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1600 aa  121  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  25.11 
 
 		 2194 aa  119  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.37 
 
 		 2035 aa  119  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1959 aa  119  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2007 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 2032 aa  112  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.73 
 
 		 889 aa  112  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.36 
 
 		 1427 aa  111  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.24 
 
 		 3027 aa  110  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 2294 aa  109  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.79 
 
 		 1381 aa  108  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1467 aa  106  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  26.33 
 
 		 2510 aa  105  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  28.55 
 
 		 1008 aa  105  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  28.55 
 
 		 1008 aa  105  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  24.12 
 
 		 722 aa  105  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.34 
 
 		 2277 aa  104  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  23 
 
 		 2191 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1527 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1917 aa  102  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1611 aa  102  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1551 aa  102  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1942 aa  102  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.78 
 
 		 1609 aa  101  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  28.03 
 
 		 1345 aa  101  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  32.17 
 
 		 2059 aa  101  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  28.03 
 
 		 1345 aa  101  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.25 
 
 		 1586 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.4 
 
 		 1595 aa  100  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1854 aa  99.8  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.38 
 
 		 1576 aa  99.8  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1628 aa  99.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1520 aa  99.8  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.88 
 
 		 1614 aa  99.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 913 aa  98.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  31.94 
 
 		 2035 aa  98.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1602 aa  98.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.95 
 
 		 764 aa  98.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.11 
 
 		 678 aa  97.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  25.05 
 
 		 2443 aa  97.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.7 
 
 		 1572 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1840 aa  98.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35.96 
 
 		 482 aa  98.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  35.96 
 
 		 474 aa  97.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  53 
 
 		 232 aa  97.1  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1390 aa  97.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  42.86 
 
 		 554 aa  96.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 3073 aa  97.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  26.33 
 
 		 2542 aa  96.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.87 
 
 		 2349 aa  96.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  41.13 
 
 		 302 aa  95.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  27.12 
 
 		 705 aa  95.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1550 aa  95.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  26.01 
 
 		 917 aa  94.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1547 aa  93.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.14 
 
 		 1560 aa  94  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>