153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2894 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  66.06 
 
 		 929 aa  778    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2433  DNA polymerase B region  72.51 
 
 		 1773 aa  1555    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.897381  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  100 
 
 		 1345 aa  2737    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  70.03 
 
 		 912 aa  835    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  66.76 
 
 		 1353 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  44.07 
 
 		 795 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  40.81 
 
 		 812 aa  421  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  43.18 
 
 		 796 aa  416  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  41.54 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  41.56 
 
 		 821 aa  393  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  29.57 
 
 		 910 aa  161  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  29.2 
 
 		 932 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.83 
 
 		 794 aa  153  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.78 
 
 		 786 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  27.89 
 
 		 941 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  29.54 
 
 		 783 aa  144  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  27.45 
 
 		 785 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  28.47 
 
 		 784 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  26 
 
 		 781 aa  132  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  27.5 
 
 		 783 aa  130  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  24.56 
 
 		 1058 aa  119  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.34 
 
 		 1087 aa  117  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  25.8 
 
 		 982 aa  112  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  25.68 
 
 		 1044 aa  111  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  25.42 
 
 		 784 aa  107  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  25.38 
 
 		 1070 aa  102  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 801 aa  102  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.66 
 
 		 794 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  25.67 
 
 		 787 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  23.35 
 
 		 816 aa  99.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  26.24 
 
 		 788 aa  97.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.05 
 
 		 787 aa  97.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 787 aa  97.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 789 aa  96.3  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  26.22 
 
 		 787 aa  96.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 789 aa  96.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 789 aa  96.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 789 aa  95.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  28.13 
 
 		 795 aa  95.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  25.15 
 
 		 789 aa  94.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.05 
 
 		 787 aa  94.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  24.36 
 
 		 811 aa  93.6  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  24.65 
 
 		 1459 aa  92  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  24.47 
 
 		 790 aa  90.1  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  24.38 
 
 		 786 aa  90.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  27.02 
 
 		 835 aa  90.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26.98 
 
 		 807 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.85 
 
 		 786 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  25 
 
 		 793 aa  90.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  25.22 
 
 		 795 aa  89.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  24.31 
 
 		 786 aa  89  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  27.94 
 
 		 810 aa  89  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 794 aa  88.6  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.98 
 
 		 786 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  26.33 
 
 		 799 aa  88.2  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  30.09 
 
 		 816 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  27.2 
 
 		 810 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  26.72 
 
 		 810 aa  87  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  26.46 
 
 		 786 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  27.95 
 
 		 797 aa  87  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.62 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.54 
 
 		 787 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  26.57 
 
 		 780 aa  86.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24 
 
 		 782 aa  86.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  27.95 
 
 		 808 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 793 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  25.84 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  27.29 
 
 		 783 aa  86.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  24.36 
 
 		 788 aa  85.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  24.73 
 
 		 820 aa  85.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  27.84 
 
 		 791 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  26.99 
 
 		 783 aa  84.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  26.99 
 
 		 783 aa  84.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  26.99 
 
 		 783 aa  84.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  25.5 
 
 		 821 aa  84  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  26.91 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.36 
 
 		 788 aa  82.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  25.43 
 
 		 780 aa  82.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  25.33 
 
 		 781 aa  82.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  26.52 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4180  DNA polymerase II  28.96 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.461299  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  26.52 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  26.52 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  26.52 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  26.52 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  26.5 
 
 		 809 aa  80.9  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  24.07 
 
 		 791 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 783 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  26.3 
 
 		 818 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 790 aa  80.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.43 
 
 		 792 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  26.29 
 
 		 783 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 783 aa  80.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  23.66 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  27.71 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.94 
 
 		 788 aa  79  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>