155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0393 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  100 
 
 		 794 aa  1600    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  51.38 
 
 		 785 aa  790    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  51.89 
 
 		 783 aa  785    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  51.39 
 
 		 784 aa  750    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  51.75 
 
 		 786 aa  795    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  49.36 
 
 		 783 aa  744    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  47.47 
 
 		 781 aa  734    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  31.44 
 
 		 764 aa  422  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  30.91 
 
 		 781 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  30.04 
 
 		 780 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  30.3 
 
 		 780 aa  350  5e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  29.48 
 
 		 810 aa  339  9e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  28.02 
 
 		 811 aa  324  5e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  28.35 
 
 		 941 aa  295  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  29.44 
 
 		 910 aa  293  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  29.48 
 
 		 784 aa  266  8.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 		 912 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.29 
 
 		 932 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  28.19 
 
 		 982 aa  257  8e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  28.46 
 
 		 812 aa  248  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  28.15 
 
 		 796 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  26.67 
 
 		 1070 aa  237  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  28.28 
 
 		 1044 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  27.28 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  28.46 
 
 		 821 aa  231  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  27.51 
 
 		 818 aa  230  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  26.83 
 
 		 1058 aa  226  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  27.78 
 
 		 929 aa  220  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  28.43 
 
 		 854 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  28.52 
 
 		 853 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  27.36 
 
 		 853 aa  213  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.67 
 
 		 1087 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  27.18 
 
 		 854 aa  208  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  28.79 
 
 		 607 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  30 
 
 		 1353 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  25.47 
 
 		 871 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.84 
 
 		 816 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  28.06 
 
 		 835 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  27.51 
 
 		 791 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  27.37 
 
 		 787 aa  178  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  27.55 
 
 		 816 aa  178  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  25.96 
 
 		 877 aa  177  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  28.1 
 
 		 787 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  26 
 
 		 882 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  27.75 
 
 		 787 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  26.65 
 
 		 789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25.89 
 
 		 852 aa  173  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.63 
 
 		 787 aa  172  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.98 
 
 		 787 aa  171  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  25.72 
 
 		 789 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  26.17 
 
 		 793 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 794 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  27.47 
 
 		 783 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  27.33 
 
 		 783 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  26.9 
 
 		 788 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  24.8 
 
 		 1463 aa  164  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  27.33 
 
 		 783 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.61 
 
 		 782 aa  163  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  27.2 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  26.79 
 
 		 799 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  26.34 
 
 		 792 aa  162  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  26.45 
 
 		 786 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  27.29 
 
 		 787 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  26.66 
 
 		 786 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.4 
 
 		 818 aa  160  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  26.67 
 
 		 786 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  26.1 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  26.67 
 
 		 786 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  26.1 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  25.65 
 
 		 1485 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  26.45 
 
 		 792 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  26.9 
 
 		 990 aa  158  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  25.59 
 
 		 783 aa  158  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  26.67 
 
 		 820 aa  157  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  26.69 
 
 		 794 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  26.69 
 
 		 794 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  25.9 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.97 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.93 
 
 		 786 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  25.24 
 
 		 1459 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  28.83 
 
 		 1345 aa  153  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  25.58 
 
 		 793 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  25.75 
 
 		 810 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 788 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  29.16 
 
 		 807 aa  151  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  27.55 
 
 		 821 aa  150  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  26.38 
 
 		 794 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 791 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  25.72 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 810 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  26.69 
 
 		 786 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 795 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  26.83 
 
 		 787 aa  147  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  26.79 
 
 		 788 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  23.5 
 
 		 790 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  26.32 
 
 		 801 aa  144  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>