141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63206 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  57.29 
 
 		 1044 aa  1189    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  62.83 
 
 		 1058 aa  1328    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  49.3 
 
 		 1087 aa  1001    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  100 
 
 		 1070 aa  2236    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  54.9 
 
 		 982 aa  1078    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  30.63 
 
 		 910 aa  354  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  30.46 
 
 		 932 aa  345  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  28.94 
 
 		 941 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03700  zeta DNA polymerase, putative  29.73 
 
 		 1940 aa  302  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.634072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  27.52 
 
 		 1681 aa  298  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  27.19 
 
 		 1489 aa  254  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  29.32 
 
 		 786 aa  251  7e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  26.67 
 
 		 794 aa  237  9e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  28.97 
 
 		 783 aa  226  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  28.53 
 
 		 784 aa  225  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  26.9 
 
 		 785 aa  220  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  29.09 
 
 		 783 aa  215  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  27.23 
 
 		 781 aa  214  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  27.15 
 
 		 784 aa  212  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  27.68 
 
 		 780 aa  205  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  27.68 
 
 		 781 aa  206  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  27.63 
 
 		 990 aa  202  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  27.1 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  28.03 
 
 		 810 aa  195  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  26.77 
 
 		 812 aa  194  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  27.77 
 
 		 796 aa  193  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  27.07 
 
 		 821 aa  183  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  25.08 
 
 		 818 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25.46 
 
 		 912 aa  181  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  25.2 
 
 		 795 aa  172  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  28.02 
 
 		 811 aa  171  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  24.61 
 
 		 1459 aa  171  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  24.97 
 
 		 929 aa  161  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  29.1 
 
 		 1353 aa  160  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  27.86 
 
 		 1463 aa  157  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  24.62 
 
 		 1485 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  25.93 
 
 		 818 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  25.49 
 
 		 793 aa  141  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  27.49 
 
 		 835 aa  138  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  26.73 
 
 		 787 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.25 
 
 		 808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  25.32 
 
 		 786 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 792 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.34 
 
 		 816 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 820 aa  132  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 786 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  25.75 
 
 		 787 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 787 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.28 
 
 		 782 aa  130  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.03 
 
 		 787 aa  128  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  26.44 
 
 		 788 aa  128  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  23.55 
 
 		 810 aa  128  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  25.28 
 
 		 816 aa  128  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  25.52 
 
 		 783 aa  127  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  24.57 
 
 		 787 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  23.64 
 
 		 810 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25.42 
 
 		 791 aa  127  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  25.36 
 
 		 783 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  23.49 
 
 		 786 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  28.16 
 
 		 789 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 783 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  28.16 
 
 		 789 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  28.16 
 
 		 789 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 783 aa  125  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 783 aa  125  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  23.68 
 
 		 807 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  25.2 
 
 		 783 aa  125  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  25.2 
 
 		 783 aa  125  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  25.2 
 
 		 783 aa  124  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  23.19 
 
 		 810 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 809 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  25.76 
 
 		 789 aa  124  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  25.7 
 
 		 783 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 783 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  26.55 
 
 		 794 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  25.11 
 
 		 788 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  26.55 
 
 		 794 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  25.18 
 
 		 801 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  26.39 
 
 		 794 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 783 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 783 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 821 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  26.03 
 
 		 793 aa  121  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  25.12 
 
 		 790 aa  121  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 783 aa  121  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 788 aa  121  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  25.18 
 
 		 787 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.58 
 
 		 795 aa  120  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  27.87 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  26.2 
 
 		 809 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  24.95 
 
 		 797 aa  119  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  25.12 
 
 		 791 aa  119  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  25.91 
 
 		 809 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  25.37 
 
 		 789 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 786 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 786 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.3 
 
 		 794 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  25 
 
 		 787 aa  117  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 790 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>