149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0530 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  96.41 
 
 		 780 aa  1524    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  76.6 
 
 		 810 aa  1249    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  54.28 
 
 		 811 aa  833    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  95.13 
 
 		 780 aa  1511    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  100 
 
 		 781 aa  1585    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  32.17 
 
 		 785 aa  362  2e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  31.12 
 
 		 794 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  30.1 
 
 		 786 aa  350  7e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  30.53 
 
 		 783 aa  341  4e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  29.48 
 
 		 781 aa  331  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  29.33 
 
 		 784 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.66 
 
 		 941 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  29.17 
 
 		 783 aa  312  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  29.22 
 
 		 910 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  29.07 
 
 		 932 aa  299  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  31.49 
 
 		 607 aa  233  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  29.48 
 
 		 835 aa  221  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  27.19 
 
 		 877 aa  220  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  26.78 
 
 		 982 aa  212  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 		 882 aa  211  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  28.18 
 
 		 853 aa  206  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  27.68 
 
 		 1070 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.62 
 
 		 1058 aa  204  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  28.07 
 
 		 1087 aa  203  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  25.55 
 
 		 853 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  26.49 
 
 		 784 aa  200  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  28.48 
 
 		 1485 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  27.49 
 
 		 854 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  29.24 
 
 		 852 aa  197  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  28.8 
 
 		 854 aa  196  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  28.77 
 
 		 1044 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25.73 
 
 		 912 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  26.73 
 
 		 871 aa  181  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  29.81 
 
 		 1459 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.69 
 
 		 794 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.82 
 
 		 782 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  27.33 
 
 		 818 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.39 
 
 		 812 aa  170  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  23.03 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  31.66 
 
 		 1463 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  28.29 
 
 		 990 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  25.38 
 
 		 796 aa  167  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  27.21 
 
 		 793 aa  167  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  24.93 
 
 		 795 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26.57 
 
 		 807 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 790 aa  160  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.73 
 
 		 789 aa  158  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.71 
 
 		 821 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  25.4 
 
 		 792 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  26.24 
 
 		 821 aa  154  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  26.11 
 
 		 808 aa  153  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 820 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  26.6 
 
 		 809 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  23.7 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.29 
 
 		 788 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.61 
 
 		 799 aa  151  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 810 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  26.27 
 
 		 809 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  26.73 
 
 		 797 aa  149  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 786 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 786 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  22.44 
 
 		 783 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  22.44 
 
 		 783 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  22.44 
 
 		 783 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  25.33 
 
 		 810 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.9 
 
 		 810 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  22.44 
 
 		 783 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  22.3 
 
 		 783 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  22.3 
 
 		 783 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  26.36 
 
 		 809 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  28.49 
 
 		 1353 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  23.01 
 
 		 791 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  25.94 
 
 		 809 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  22.16 
 
 		 783 aa  145  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  27.19 
 
 		 818 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.32 
 
 		 816 aa  144  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  22.44 
 
 		 783 aa  144  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  24.72 
 
 		 796 aa  144  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23 
 
 		 787 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  22.38 
 
 		 790 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  22.16 
 
 		 783 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.14 
 
 		 792 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  22.92 
 
 		 786 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 787 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  22.95 
 
 		 816 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.27 
 
 		 795 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 788 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  21.89 
 
 		 786 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.78 
 
 		 787 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  28.61 
 
 		 723 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  21.89 
 
 		 788 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  23.26 
 
 		 716 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 787 aa  139  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.76 
 
 		 787 aa  138  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  22.46 
 
 		 793 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  23.58 
 
 		 792 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  23.93 
 
 		 796 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  22.99 
 
 		 790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  21.17 
 
 		 789 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  25.5 
 
 		 801 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>