149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1378 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  94.62 
 
 		 780 aa  1506    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  77.04 
 
 		 810 aa  1254    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  55.56 
 
 		 811 aa  840    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  100 
 
 		 780 aa  1575    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  94.37 
 
 		 781 aa  1481    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  30.04 
 
 		 794 aa  355  1e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  30.71 
 
 		 785 aa  353  8e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  29.35 
 
 		 786 aa  348  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  29.97 
 
 		 783 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.46 
 
 		 941 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  28.64 
 
 		 781 aa  320  7.999999999999999e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  28.3 
 
 		 784 aa  318  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  28.5 
 
 		 783 aa  306  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  29.04 
 
 		 910 aa  302  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.77 
 
 		 932 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 		 607 aa  234  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  29.66 
 
 		 835 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  27.15 
 
 		 877 aa  210  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 		 882 aa  207  7e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  26.55 
 
 		 982 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  27.89 
 
 		 1485 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  25.35 
 
 		 853 aa  197  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  26.06 
 
 		 784 aa  197  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  27.68 
 
 		 853 aa  197  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  27.1 
 
 		 1070 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.59 
 
 		 1058 aa  193  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  27.81 
 
 		 854 aa  193  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  27.17 
 
 		 854 aa  192  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  29.05 
 
 		 852 aa  188  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  26.95 
 
 		 1087 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25.26 
 
 		 912 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  26.56 
 
 		 871 aa  183  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  28.17 
 
 		 1044 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  29.51 
 
 		 1459 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  22.73 
 
 		 764 aa  173  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.79 
 
 		 794 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  25.31 
 
 		 796 aa  171  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.96 
 
 		 782 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  26.95 
 
 		 818 aa  168  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.76 
 
 		 812 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  31.75 
 
 		 1463 aa  167  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  27.99 
 
 		 990 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  25.13 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.44 
 
 		 789 aa  161  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  25.95 
 
 		 793 aa  160  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26.97 
 
 		 807 aa  157  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 792 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.27 
 
 		 790 aa  154  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 786 aa  154  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  25.15 
 
 		 821 aa  153  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 809 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.45 
 
 		 799 aa  152  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  26.39 
 
 		 808 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.02 
 
 		 821 aa  150  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.64 
 
 		 816 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.16 
 
 		 783 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 783 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 783 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 783 aa  149  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.02 
 
 		 783 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.02 
 
 		 783 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  25.36 
 
 		 796 aa  148  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  24.05 
 
 		 809 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23.66 
 
 		 787 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  26.69 
 
 		 818 aa  147  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  25.7 
 
 		 797 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  28.11 
 
 		 1353 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.38 
 
 		 787 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  23.5 
 
 		 820 aa  146  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.05 
 
 		 809 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 810 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  24.1 
 
 		 810 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  24 
 
 		 810 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 783 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  21.73 
 
 		 790 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  28.44 
 
 		 723 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 786 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  24.84 
 
 		 796 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  23.65 
 
 		 809 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.29 
 
 		 792 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  24.14 
 
 		 792 aa  142  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 786 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  22.73 
 
 		 791 aa  141  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.42 
 
 		 795 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  22.64 
 
 		 788 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.01 
 
 		 787 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 788 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.74 
 
 		 787 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  23.31 
 
 		 716 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  26.83 
 
 		 793 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  24.05 
 
 		 788 aa  138  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.07 
 
 		 787 aa  137  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.29 
 
 		 783 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  22.54 
 
 		 786 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.03 
 
 		 786 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  22.49 
 
 		 793 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>