More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5746 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  100 
 
 		 2652 aa  5441    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.1 
 
 		 2558 aa  1169    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.31 
 
 		 2554 aa  1135    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  47.11 
 
 		 2479 aa  1924    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  49.72 
 
 		 2443 aa  1978    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.43 
 
 		 2698 aa  853    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  47.87 
 
 		 2510 aa  1934    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  37.32 
 
 		 2534 aa  1430    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  29.93 
 
 		 1528 aa  511  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  29.31 
 
 		 1446 aa  493  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  31.55 
 
 		 1505 aa  457  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  31.86 
 
 		 1489 aa  452  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  31.48 
 
 		 1496 aa  452  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  32.63 
 
 		 1447 aa  440  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  30.18 
 
 		 2417 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  30.18 
 
 		 2458 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  29.67 
 
 		 1540 aa  387  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  29.67 
 
 		 1540 aa  387  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  29.67 
 
 		 1540 aa  387  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  31.4 
 
 		 1485 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1488 aa  354  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.58 
 
 		 1976 aa  347  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  30.91 
 
 		 927 aa  258  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  31.57 
 
 		 921 aa  257  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  31.54 
 
 		 952 aa  257  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  31.29 
 
 		 910 aa  254  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  30.79 
 
 		 929 aa  254  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  30.73 
 
 		 958 aa  249  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  30.19 
 
 		 952 aa  249  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  32.1 
 
 		 989 aa  245  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  32.54 
 
 		 881 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  29.55 
 
 		 952 aa  235  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  31.38 
 
 		 940 aa  226  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  28.17 
 
 		 956 aa  224  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  31.87 
 
 		 922 aa  223  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  29.86 
 
 		 886 aa  223  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  31.42 
 
 		 939 aa  222  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  30.64 
 
 		 994 aa  221  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 920 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  29.49 
 
 		 980 aa  218  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  30.78 
 
 		 942 aa  218  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  30.94 
 
 		 954 aa  215  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  30.94 
 
 		 954 aa  215  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  30.94 
 
 		 954 aa  215  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 955 aa  214  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 923 aa  207  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  31.24 
 
 		 852 aa  203  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  29.54 
 
 		 893 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  30.26 
 
 		 944 aa  200  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  30.49 
 
 		 958 aa  199  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  30.49 
 
 		 962 aa  199  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  30.49 
 
 		 962 aa  199  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 2032 aa  198  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 2031 aa  194  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 2031 aa  193  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  27.72 
 
 		 2031 aa  192  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  29.01 
 
 		 928 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  28.79 
 
 		 891 aa  184  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1825 aa  179  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1825 aa  179  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  33.86 
 
 		 1806 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  25.31 
 
 		 2035 aa  170  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  26.11 
 
 		 2059 aa  167  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.69 
 
 		 3456 aa  126  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  76.54 
 
 		 119 aa  125  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1488 aa  113  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1140 aa  106  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1126 aa  105  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.44 
 
 		 903 aa  104  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 3320 aa  101  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.35 
 
 		 1586 aa  97.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.26 
 
 		 1595 aa  96.3  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.95 
 
 		 1338 aa  95.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1352 aa  94.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.43 
 
 		 1576 aa  94  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.15 
 
 		 1600 aa  91.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.07 
 
 		 2094 aa  91.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.27 
 
 		 1614 aa  89.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.11 
 
 		 2096 aa  88.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.62 
 
 		 2035 aa  87.8  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1959 aa  87.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.2 
 
 		 2076 aa  85.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  22.65 
 
 		 1140 aa  85.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.17 
 
 		 1572 aa  84.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1917 aa  84.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  24.94 
 
 		 1073 aa  84.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 927 aa  84  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1550 aa  84  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.93 
 
 		 889 aa  83.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1753 aa  82.8  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1840 aa  82  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1520 aa  81.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1433 aa  80.5  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1834 aa  79.7  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1551 aa  79  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1328 aa  77.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1527 aa  77.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.43 
 
 		 1609 aa  76.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23 
 
 		 1467 aa  76.3  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>