254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6407 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  36.66 
 
 		 2076 aa  967    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  32.55 
 
 		 2542 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  40.3 
 
 		 2191 aa  1061    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  35.52 
 
 		 2286 aa  864    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  34.32 
 
 		 2007 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  38.39 
 
 		 2290 aa  974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  100 
 
 		 2194 aa  4379    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  36.7 
 
 		 2145 aa  975    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  31.64 
 
 		 2615 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  36.29 
 
 		 1140 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1834 aa  143  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.4 
 
 		 2094 aa  136  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.93 
 
 		 2138 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.21 
 
 		 2017 aa  124  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 3273 aa  102  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 927 aa  97.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.98 
 
 		 2117 aa  97.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  23.99 
 
 		 2652 aa  95.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  23.92 
 
 		 2413 aa  93.2  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 690 aa  90.1  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 2448 aa  89.4  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1517 aa  87  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.66 
 
 		 1271 aa  86.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  23.82 
 
 		 2497 aa  85.9  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  26.62 
 
 		 2443 aa  85.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 3333 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1352 aa  85.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.7 
 
 		 2437 aa  83.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.44 
 
 		 2096 aa  82.8  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  24.52 
 
 		 1427 aa  82.4  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 		 2283 aa  82.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.92 
 
 		 1953 aa  82.4  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1600 aa  82  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 2401 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.6 
 
 		 788 aa  79.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.6 
 
 		 788 aa  79.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 2374 aa  79.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 2486 aa  79.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 913 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1628 aa  78.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.19 
 
 		 764 aa  77.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.32 
 
 		 705 aa  76.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.04 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  25.57 
 
 		 2510 aa  75.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  27.01 
 
 		 2458 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1411 aa  75.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1400 aa  75.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.22 
 
 		 741 aa  74.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.89 
 
 		 1467 aa  74.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.43 
 
 		 2149 aa  74.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.92 
 
 		 1381 aa  74.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  22.67 
 
 		 2762 aa  73.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1362 aa  73.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  21.83 
 
 		 3320 aa  72.8  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.97 
 
 		 1577 aa  72.4  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 2032 aa  72.8  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.91 
 
 		 3027 aa  72.4  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.34 
 
 		 2731 aa  72.4  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 2003 aa  72  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 6109 aa  72  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1854 aa  72.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  31.44 
 
 		 2428 aa  71.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  29.54 
 
 		 474 aa  71.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.32 
 
 		 1008 aa  70.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.32 
 
 		 1008 aa  70.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  26.78 
 
 		 2417 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  24.36 
 
 		 722 aa  70.1  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  22.44 
 
 		 866 aa  70.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 2031 aa  69.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 2031 aa  69.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.2 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 2402 aa  69.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.8 
 
 		 2658 aa  69.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  26.86 
 
 		 2031 aa  69.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1825 aa  69.3  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.29 
 
 		 1345 aa  68.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1806 aa  68.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.29 
 
 		 1345 aa  68.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1825 aa  69.3  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  21.56 
 
 		 2534 aa  68.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.88 
 
 		 1560 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  25.07 
 
 		 2513 aa  67.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 628 aa  68.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.63 
 
 		 3456 aa  65.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 867 aa  65.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  23.54 
 
 		 2479 aa  65.9  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  34.82 
 
 		 391 aa  65.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.57 
 
 		 738 aa  65.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.16 
 
 		 1609 aa  65.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.32 
 
 		 920 aa  65.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.95 
 
 		 1599 aa  64.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  25.66 
 
 		 2416 aa  65.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 605 aa  64.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 869 aa  63.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.54 
 
 		 1976 aa  64.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1551 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  23.93 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  23.17 
 
 		 2059 aa  63.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  34.51 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.93 
 
 		 1942 aa  63.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>