More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1441 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  35.37 
 
 
2017 aa  988    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  100 
 
 
2138 aa  4408    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.25 
 
 
1834 aa  315  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30 
 
 
2117 aa  234  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.5 
 
 
482 aa  188  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  34.8 
 
 
474 aa  184  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.33 
 
 
2094 aa  181  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 
1352 aa  181  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  31.05 
 
 
1517 aa  180  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.39 
 
 
2096 aa  172  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.38 
 
 
3456 aa  169  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 
3320 aa  164  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  23.51 
 
 
1488 aa  162  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 
1126 aa  162  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.5 
 
 
2076 aa  160  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 
1600 aa  159  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.38 
 
 
1271 aa  157  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  23.53 
 
 
2494 aa  153  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  24.95 
 
 
1140 aa  146  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.29 
 
 
1976 aa  145  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  24.72 
 
 
2290 aa  144  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.1 
 
 
2145 aa  143  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 
1140 aa  142  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  26.93 
 
 
2059 aa  139  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  26.93 
 
 
2035 aa  139  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  24.08 
 
 
1628 aa  138  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  37.07 
 
 
554 aa  132  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 
927 aa  127  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 
2286 aa  127  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.44 
 
 
1959 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 
1917 aa  123  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 
1942 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 
690 aa  119  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.85 
 
 
2513 aa  118  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  22.99 
 
 
3333 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 
1669 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.72 
 
 
2149 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.92 
 
 
1732 aa  116  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.2 
 
 
1953 aa  115  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 
1840 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.98 
 
 
3027 aa  112  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 
1550 aa  111  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 
1520 aa  111  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  26.1 
 
 
2497 aa  110  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 
2035 aa  110  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  23.22 
 
 
2283 aa  109  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.17 
 
 
1614 aa  109  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.86 
 
 
1599 aa  108  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.3 
 
 
2349 aa  106  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 
3193 aa  106  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 
2401 aa  106  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 
2437 aa  107  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.17 
 
 
903 aa  105  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.77 
 
 
889 aa  105  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.26 
 
 
2277 aa  105  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.57 
 
 
1576 aa  105  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.67 
 
 
2658 aa  105  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.86 
 
 
1547 aa  105  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 
2003 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.43 
 
 
2032 aa  105  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.97 
 
 
1531 aa  105  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  22.2 
 
 
2031 aa  105  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  24.18 
 
 
2191 aa  104  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.12 
 
 
2031 aa  103  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  23.01 
 
 
2448 aa  103  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.58 
 
 
788 aa  103  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  25.98 
 
 
764 aa  103  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.58 
 
 
788 aa  103  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 
2007 aa  103  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.25 
 
 
1527 aa  102  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.5 
 
 
1551 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.8 
 
 
2762 aa  101  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.49 
 
 
705 aa  100  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  24.17 
 
 
2194 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.47 
 
 
1467 aa  100  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.47 
 
 
741 aa  99.8  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  22.23 
 
 
2402 aa  99.8  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  21.7 
 
 
1554 aa  99.8  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.96 
 
 
1577 aa  98.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.03 
 
 
1825 aa  97.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  29.89 
 
 
920 aa  97.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.03 
 
 
1806 aa  97.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.98 
 
 
1568 aa  97.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  25.64 
 
 
2416 aa  97.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 
1433 aa  96.3  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.27 
 
 
738 aa  95.9  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  21.95 
 
 
1602 aa  94.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 
913 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 
1177 aa  95.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 
867 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.78 
 
 
1560 aa  95.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.12 
 
 
678 aa  95.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.36 
 
 
1384 aa  94.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.84 
 
 
924 aa  94  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.92 
 
 
1485 aa  94  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 
1611 aa  94  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.41 
 
 
1409 aa  93.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  29.77 
 
 
917 aa  93.6  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.94 
 
 
1825 aa  93.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.04 
 
 
1345 aa  92.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>