More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7436 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  43.49 
 
 		 1140 aa  651    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  43.63 
 
 		 2145 aa  1373    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  41.9 
 
 		 2290 aa  1353    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  35.86 
 
 		 2191 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  36.92 
 
 		 2194 aa  946    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  40.47 
 
 		 2286 aa  1200    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  35.04 
 
 		 2615 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  35.48 
 
 		 2007 aa  966    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  100 
 
 		 2076 aa  4221    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  29.95 
 
 		 2542 aa  635  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1834 aa  209  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.95 
 
 		 2017 aa  169  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.39 
 
 		 2138 aa  161  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.18 
 
 		 2117 aa  154  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.1 
 
 		 3456 aa  148  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.68 
 
 		 2096 aa  145  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.12 
 
 		 2094 aa  143  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 927 aa  137  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  28.5 
 
 		 1976 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1517 aa  131  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  25 
 
 		 2497 aa  127  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 690 aa  127  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.68 
 
 		 1271 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.58 
 
 		 482 aa  117  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.49 
 
 		 903 aa  117  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  22.07 
 
 		 3320 aa  114  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.47 
 
 		 474 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  28.42 
 
 		 788 aa  114  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  28.42 
 
 		 788 aa  114  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 		 2486 aa  112  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1600 aa  111  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.43 
 
 		 889 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.75 
 
 		 920 aa  112  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.52 
 
 		 1953 aa  111  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 2003 aa  110  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  27.37 
 
 		 764 aa  107  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1467 aa  107  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.47 
 
 		 917 aa  108  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 955 aa  106  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.61 
 
 		 678 aa  105  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.41 
 
 		 3273 aa  104  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.3 
 
 		 2149 aa  104  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.14 
 
 		 1427 aa  103  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.76 
 
 		 1599 aa  103  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.65 
 
 		 2225 aa  103  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.01 
 
 		 2413 aa  103  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1352 aa  102  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.5 
 
 		 3027 aa  102  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  28.48 
 
 		 705 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  27.14 
 
 		 1053 aa  101  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 2942 aa  101  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 3193 aa  99  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 913 aa  98.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.66 
 
 		 741 aa  97.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  27.48 
 
 		 2443 aa  98.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 869 aa  97.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.07 
 
 		 2401 aa  97.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.14 
 
 		 2035 aa  96.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.74 
 
 		 1577 aa  96.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 2437 aa  96.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.67 
 
 		 2246 aa  96.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  25.42 
 
 		 886 aa  95.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  24.28 
 
 		 2224 aa  95.9  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  24.28 
 
 		 2224 aa  95.9  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1763 aa  94.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.5 
 
 		 2224 aa  94.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1126 aa  92.8  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.11 
 
 		 765 aa  91.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 2374 aa  92  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 628 aa  92  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.28 
 
 		 1345 aa  90.5  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  25.89 
 
 		 2059 aa  90.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.28 
 
 		 1345 aa  90.5  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 2031 aa  90.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  22.69 
 
 		 2283 aa  89.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.11 
 
 		 2031 aa  89.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1547 aa  89.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  24.64 
 
 		 738 aa  89  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1008 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1008 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  25.68 
 
 		 2035 aa  88.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1628 aa  88.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  23.79 
 
 		 2448 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1488 aa  87.4  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 3073 aa  87.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  24.53 
 
 		 2652 aa  87  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.47 
 
 		 2731 aa  86.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1558 aa  86.7  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1942 aa  86.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1433 aa  85.9  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1149 aa  85.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 2294 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.38 
 
 		 2221 aa  84.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 881 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  22.45 
 
 		 2402 aa  84.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1917 aa  84.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.43 
 
 		 2658 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 956 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  22.84 
 
 		 3333 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  25.74 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>