211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2224 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2494 aa  5157    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.16 
 
 		 2138 aa  147  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  23.13 
 
 		 2117 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.88 
 
 		 2017 aa  142  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1834 aa  127  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  40.36 
 
 		 2428 aa  105  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  38.65 
 
 		 554 aa  104  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  40.54 
 
 		 474 aa  103  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  40.54 
 
 		 482 aa  102  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1517 aa  97.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  38.61 
 
 		 2416 aa  95.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  39.67 
 
 		 2762 aa  93.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  37.4 
 
 		 2094 aa  90.1  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  41.53 
 
 		 628 aa  90.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  40.62 
 
 		 3333 aa  88.6  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  36.49 
 
 		 2497 aa  87.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  48.21 
 
 		 232 aa  85.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1854 aa  83.2  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  39.23 
 
 		 2283 aa  82  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  40.46 
 
 		 622 aa  82.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  29.26 
 
 		 2513 aa  81.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 2401 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.17 
 
 		 1381 aa  80.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  37.16 
 
 		 2448 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.94 
 
 		 3456 aa  80.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  32.78 
 
 		 520 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  38.17 
 
 		 2437 aa  79  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  39.25 
 
 		 2096 aa  77.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  39.39 
 
 		 2402 aa  77  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  41.28 
 
 		 298 aa  77  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  41.28 
 
 		 298 aa  77  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  35.43 
 
 		 2165 aa  76.3  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  24.07 
 
 		 917 aa  76.3  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  23.15 
 
 		 920 aa  76.3  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  22.39 
 
 		 1518 aa  76.3  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  41.51 
 
 		 316 aa  75.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  39.32 
 
 		 2286 aa  75.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  34.45 
 
 		 2075 aa  75.5  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  41.82 
 
 		 391 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 690 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  74.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  33.11 
 
 		 2413 aa  74.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 927 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  34.62 
 
 		 311 aa  73.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  33.11 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.47 
 
 		 2145 aa  72.8  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  37.19 
 
 		 2035 aa  71.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  40.37 
 
 		 2290 aa  70.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  34.17 
 
 		 2076 aa  69.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  38.39 
 
 		 3073 aa  69.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  22.44 
 
 		 903 aa  69.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1488 aa  68.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.46 
 
 		 1467 aa  67.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1198 aa  68.6  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  36.44 
 
 		 1976 aa  67.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  36.7 
 
 		 2374 aa  67.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1352 aa  66.6  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  22.33 
 
 		 1140 aa  65.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  22.07 
 
 		 889 aa  65.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  24.35 
 
 		 1150 aa  65.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  24.35 
 
 		 1150 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1150 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  37.25 
 
 		 1959 aa  63.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  21.85 
 
 		 1046 aa  62.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  22.55 
 
 		 1576 aa  62.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.7 
 
 		 2149 aa  62  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  41.54 
 
 		 1732 aa  62  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  37.23 
 
 		 2542 aa  62  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  32.71 
 
 		 302 aa  61.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  38.05 
 
 		 1271 aa  61.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  31.79 
 
 		 1140 aa  61.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1177 aa  61.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 2942 aa  62  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  41.11 
 
 		 2007 aa  61.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  41.54 
 
 		 396 aa  61.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  30.09 
 
 		 2194 aa  60.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1457  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1423 aa  60.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  23.61 
 
 		 1150 aa  60.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1433 aa  60.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  22.71 
 
 		 1577 aa  60.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  36.63 
 
 		 2191 aa  60.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  36.69 
 
 		 1528 aa  60.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  39.02 
 
 		 2615 aa  60.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  37.23 
 
 		 2658 aa  59.7  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  31.53 
 
 		 2510 aa  59.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  33.61 
 
 		 765 aa  58.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  38.46 
 
 		 2225 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  31.96 
 
 		 2349 aa  58.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.69 
 
 		 3027 aa  57.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  36.46 
 
 		 1628 aa  57.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  48.98 
 
 		 340 aa  57.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  36.36 
 
 		 2731 aa  57  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  21.77 
 
 		 3193 aa  56.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  35.45 
 
 		 1600 aa  56.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1278  cell wall-associated protein  38.1 
 
 		 258 aa  55.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  23.94 
 
 		 1508 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1531 aa  55.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.58 
 
 		 1614 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1753 aa  55.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  37.1 
 
 		 765 aa  55.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>