More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1373 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  30.31 
 
 		 2031 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.42 
 
 		 2031 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.37 
 
 		 2031 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  100 
 
 		 1976 aa  3997    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.05 
 
 		 2032 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1825 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.02 
 
 		 1825 aa  563  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1806 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  26.29 
 
 		 2443 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  31.74 
 
 		 2479 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  31.36 
 
 		 2510 aa  366  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 2558 aa  361  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  29.25 
 
 		 2554 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  29.58 
 
 		 2652 aa  325  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  28.78 
 
 		 2534 aa  296  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  31.29 
 
 		 2698 aa  271  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  27.75 
 
 		 1485 aa  269  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  29.4 
 
 		 2059 aa  249  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  29.12 
 
 		 1528 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  27.74 
 
 		 1540 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  27.74 
 
 		 1540 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  27.74 
 
 		 1540 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  29.43 
 
 		 2035 aa  241  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  26.85 
 
 		 1496 aa  240  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1517 aa  239  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  28.06 
 
 		 2458 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  27.86 
 
 		 2417 aa  237  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  26.46 
 
 		 1489 aa  236  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  26.63 
 
 		 1447 aa  235  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  26.03 
 
 		 1505 aa  234  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1834 aa  232  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  25.97 
 
 		 1446 aa  227  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1488 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.86 
 
 		 2117 aa  199  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.91 
 
 		 2017 aa  195  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26.49 
 
 		 3456 aa  187  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  29.84 
 
 		 628 aa  176  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.79 
 
 		 2094 aa  170  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.26 
 
 		 1271 aa  162  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.44 
 
 		 2138 aa  147  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24 
 
 		 2096 aa  145  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.9 
 
 		 1467 aa  145  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1352 aa  139  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1433 aa  139  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  22.97 
 
 		 2402 aa  136  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 927 aa  135  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.51 
 
 		 764 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1488 aa  134  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 2401 aa  134  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  27.77 
 
 		 2076 aa  133  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.49 
 
 		 1381 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.55 
 
 		 1732 aa  132  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 2437 aa  131  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1840 aa  129  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.53 
 
 		 1427 aa  128  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1140 aa  128  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.83 
 
 		 1614 aa  128  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  28.32 
 
 		 989 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1328 aa  126  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  24.52 
 
 		 917 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1600 aa  125  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1917 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.98 
 
 		 788 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.98 
 
 		 788 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 2283 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 3333 aa  123  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 690 aa  122  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 2035 aa  122  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 2448 aa  122  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.53 
 
 		 705 aa  122  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.83 
 
 		 2149 aa  122  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 2294 aa  119  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.52 
 
 		 903 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1577 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.08 
 
 		 1576 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.15 
 
 		 1464 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1942 aa  116  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.17 
 
 		 2145 aa  115  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 913 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  24.25 
 
 		 920 aa  115  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.26 
 
 		 741 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  27.69 
 
 		 927 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 605 aa  114  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  23.79 
 
 		 889 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  35.15 
 
 		 474 aa  113  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.47 
 
 		 1572 aa  112  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.09 
 
 		 482 aa  111  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 869 aa  111  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1959 aa  110  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 		 2942 aa  110  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1669 aa  108  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 3320 aa  107  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1126 aa  107  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.12 
 
 		 2658 aa  107  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.67 
 
 		 1140 aa  108  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.53 
 
 		 1485 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.7 
 
 		 738 aa  107  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  26.17 
 
 		 940 aa  105  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.61 
 
 		 3027 aa  105  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 881 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>