248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2269 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  34.2 
 
 		 2554 aa  1103    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.2 
 
 		 2558 aa  1115    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  33.23 
 
 		 2698 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  100 
 
 		 2479 aa  5051    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  47.9 
 
 		 2652 aa  1895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  54.64 
 
 		 2510 aa  2266    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  58 
 
 		 2443 aa  2438    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  36.31 
 
 		 2534 aa  1363    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  30.7 
 
 		 1446 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  29.94 
 
 		 1447 aa  517  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  30.7 
 
 		 1528 aa  503  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  31.95 
 
 		 1496 aa  504  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  31.62 
 
 		 1505 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  32.07 
 
 		 1489 aa  497  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  29.71 
 
 		 1485 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  32.29 
 
 		 2417 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  32.29 
 
 		 2458 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  28.9 
 
 		 1540 aa  427  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  28.9 
 
 		 1540 aa  427  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  28.9 
 
 		 1540 aa  427  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1488 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  31.85 
 
 		 1976 aa  369  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  27.08 
 
 		 2031 aa  269  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 2031 aa  268  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  33.75 
 
 		 989 aa  260  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  31.37 
 
 		 956 aa  249  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  33.78 
 
 		 927 aa  248  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.59 
 
 		 2031 aa  246  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.64 
 
 		 2032 aa  245  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  32.12 
 
 		 886 aa  244  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  30.38 
 
 		 921 aa  243  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  30.55 
 
 		 910 aa  240  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1825 aa  237  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1825 aa  237  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  31.82 
 
 		 952 aa  234  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  32.71 
 
 		 881 aa  234  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  32.06 
 
 		 940 aa  233  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  31.66 
 
 		 939 aa  233  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1806 aa  233  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  30.24 
 
 		 952 aa  232  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  30.17 
 
 		 929 aa  231  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  29.2 
 
 		 958 aa  229  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  30.79 
 
 		 955 aa  225  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  34.18 
 
 		 922 aa  224  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  30.95 
 
 		 920 aa  223  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  32.32 
 
 		 923 aa  222  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  29.9 
 
 		 952 aa  218  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  27.95 
 
 		 980 aa  211  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  28.75 
 
 		 958 aa  210  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 		 962 aa  210  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 		 962 aa  210  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 852 aa  192  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  29.22 
 
 		 994 aa  191  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  27.95 
 
 		 954 aa  178  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  27.95 
 
 		 954 aa  178  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  27.95 
 
 		 954 aa  178  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  29.58 
 
 		 891 aa  176  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  29.49 
 
 		 942 aa  175  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  29 
 
 		 944 aa  173  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  26.59 
 
 		 2059 aa  166  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  26.49 
 
 		 2035 aa  164  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  28.71 
 
 		 893 aa  162  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1488 aa  160  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01972  hypothetical protein  44.97 
 
 		 233 aa  158  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  27.65 
 
 		 928 aa  157  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1140 aa  152  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 3320 aa  151  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1126 aa  149  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2183  hypothetical protein  35.65 
 
 		 240 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  69.14 
 
 		 119 aa  117  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.15 
 
 		 3456 aa  113  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1834 aa  101  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.37 
 
 		 2096 aa  97.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  70.69 
 
 		 103 aa  96.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  23.24 
 
 		 2117 aa  92.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 690 aa  87.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  21.4 
 
 		 2017 aa  85.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.34 
 
 		 2094 aa  84.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 927 aa  84  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  31.36 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1352 aa  83.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.74 
 
 		 889 aa  83.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.51 
 
 		 2076 aa  82.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  31.94 
 
 		 2513 aa  81.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.25 
 
 		 903 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.04 
 
 		 2035 aa  79.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.38 
 
 		 3027 aa  78.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 628 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1531 aa  77  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  21.3 
 
 		 2225 aa  76.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.52 
 
 		 1271 aa  76.3  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  22.67 
 
 		 1140 aa  76.3  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.36 
 
 		 1568 aa  74.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.1 
 
 		 913 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  21.07 
 
 		 2224 aa  73.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  24.02 
 
 		 1338 aa  73.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  21.13 
 
 		 2224 aa  73.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  21.13 
 
 		 2224 aa  73.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1600 aa  73.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1602 aa  72.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>