270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2412 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  52.53 
 
 		 922 aa  817    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  52.99 
 
 		 940 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  49.86 
 
 		 886 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  62.94 
 
 		 927 aa  852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 923 aa  1909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  44.28 
 
 		 920 aa  716    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  52.74 
 
 		 939 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  49.64 
 
 		 955 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  52.07 
 
 		 881 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  44.97 
 
 		 956 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  47.89 
 
 		 942 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  47.73 
 
 		 893 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  42.94 
 
 		 989 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  34.22 
 
 		 921 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  40.23 
 
 		 952 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  39.39 
 
 		 958 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  40.83 
 
 		 952 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  40.86 
 
 		 910 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  41.64 
 
 		 952 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  40.75 
 
 		 929 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  39.43 
 
 		 2458 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  40.15 
 
 		 2417 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  40.86 
 
 		 852 aa  416  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  37.48 
 
 		 928 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  38.47 
 
 		 954 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  38.47 
 
 		 954 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  38.79 
 
 		 944 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  38.47 
 
 		 954 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  37.54 
 
 		 980 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  38.38 
 
 		 891 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  38.18 
 
 		 994 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  38.9 
 
 		 962 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  39.13 
 
 		 958 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  38.9 
 
 		 962 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.23 
 
 		 2558 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  30.99 
 
 		 2554 aa  287  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  33.77 
 
 		 2698 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30 
 
 		 2652 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  31.59 
 
 		 2510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  33.7 
 
 		 2479 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  29.5 
 
 		 2534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  31.87 
 
 		 2443 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 3320 aa  102  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.88 
 
 		 1976 aa  97.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1126 aa  96.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.72 
 
 		 3456 aa  91.3  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1600 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.59 
 
 		 1577 aa  85.5  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.09 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.32 
 
 		 1381 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.84 
 
 		 1140 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  28.81 
 
 		 1464 aa  79  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.76 
 
 		 2017 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 2003 aa  78.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.61 
 
 		 2145 aa  77.8  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 690 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1409 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  24.34 
 
 		 1338 aa  76.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1140 aa  75.1  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1834 aa  75.1  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1488 aa  75.1  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 867 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1935 aa  75.1  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1623 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  22.58 
 
 		 903 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1400 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 480 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1147 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  24.5 
 
 		 583 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1352 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.11 
 
 		 1385 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1551 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.86 
 
 		 678 aa  71.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.61 
 
 		 2076 aa  71.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.43 
 
 		 1271 aa  70.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 927 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  29.19 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1942 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1411 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1386 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1753 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 3193 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1550 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.25 
 
 		 1467 aa  65.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  26.9 
 
 		 1710 aa  65.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1547 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.07 
 
 		 1599 aa  65.1  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1791 aa  64.7  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  20.72 
 
 		 2096 aa  64.7  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1917 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 		 2035 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 866 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  22.93 
 
 		 2138 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  30.71 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2801 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  27.7 
 
 		 1892 aa  62.4  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1419 aa  62  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>