More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0407 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  52.02 
 
 		 958 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  53.75 
 
 		 954 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  88.92 
 
 		 958 aa  1271    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  94.93 
 
 		 910 aa  1300    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  100 
 
 		 921 aa  1897    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  52.46 
 
 		 994 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  50.87 
 
 		 980 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  94.17 
 
 		 952 aa  1290    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  51.87 
 
 		 962 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  90.55 
 
 		 952 aa  1225    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  53.75 
 
 		 954 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  94.5 
 
 		 929 aa  1307    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  51.87 
 
 		 962 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  53.75 
 
 		 954 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  51.74 
 
 		 852 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  46.88 
 
 		 952 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  45.79 
 
 		 989 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  40.18 
 
 		 940 aa  492  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.2 
 
 		 2458 aa  492  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  37.87 
 
 		 920 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  40.96 
 
 		 2417 aa  486  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  41.2 
 
 		 956 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  43.31 
 
 		 881 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  34.48 
 
 		 939 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  42.24 
 
 		 955 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  41.04 
 
 		 886 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  40.75 
 
 		 927 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  34.2 
 
 		 923 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  34.84 
 
 		 922 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  37.54 
 
 		 942 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  37.26 
 
 		 891 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  37.46 
 
 		 893 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  37.09 
 
 		 944 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.43 
 
 		 2558 aa  354  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  35.65 
 
 		 928 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  34.29 
 
 		 2554 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.6 
 
 		 2698 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.57 
 
 		 2652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  31.37 
 
 		 2534 aa  268  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  31.27 
 
 		 2443 aa  267  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  29.96 
 
 		 2479 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.86 
 
 		 2510 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  37.3 
 
 		 334 aa  136  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26 
 
 		 3456 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.92 
 
 		 1976 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1126 aa  93.2  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  27.03 
 
 		 1338 aa  91.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1935 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 2003 aa  88.2  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  36.67 
 
 		 1464 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 690 aa  84  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.96 
 
 		 927 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1917 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.84 
 
 		 2145 aa  81.3  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 3320 aa  79.7  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.79 
 
 		 2017 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.98 
 
 		 2076 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.79 
 
 		 2096 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1942 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 3193 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1600 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.8 
 
 		 903 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1840 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1959 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.01 
 
 		 1381 aa  72.4  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 		 451 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1147 aa  72  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.08 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  30.81 
 
 		 2294 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1834 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 909 aa  70.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.78 
 
 		 1140 aa  70.5  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 480 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  22.45 
 
 		 1599 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  37.61 
 
 		 1892 aa  69.3  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.65 
 
 		 1560 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1466 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  28.42 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.62 
 
 		 1673 aa  68.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1386 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1490 aa  68.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1409 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1140 aa  67.4  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  27.1 
 
 		 1710 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  26.1 
 
 		 931 aa  67  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1488 aa  67  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  22.92 
 
 		 1348 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1492 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1352 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1517 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  36.36 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  36.36 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1411 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  36.36 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  26.79 
 
 		 1053 aa  65.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.67 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1551 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 867 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.13 
 
 		 1577 aa  65.1  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>