177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0177 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  29.98 
 
 		 2479 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.48 
 
 		 2443 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  99.86 
 
 		 2417 aa  4400    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  33.4 
 
 		 1485 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  36.47 
 
 		 1528 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  100 
 
 		 2458 aa  4993    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  32.5 
 
 		 1540 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  34.37 
 
 		 1489 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  32.5 
 
 		 1540 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  34.27 
 
 		 1496 aa  684    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  32.5 
 
 		 1540 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  34.06 
 
 		 1505 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  36.09 
 
 		 1447 aa  623  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  35.83 
 
 		 1446 aa  603  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2534 aa  590  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1488 aa  550  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  27.98 
 
 		 2698 aa  520  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  29.82 
 
 		 2554 aa  516  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  44.66 
 
 		 989 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  29.13 
 
 		 2558 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  41.2 
 
 		 921 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  44.41 
 
 		 940 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  41.52 
 
 		 929 aa  466  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  43.08 
 
 		 954 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  40.38 
 
 		 955 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  43.08 
 
 		 954 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.12 
 
 		 2510 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  41.67 
 
 		 952 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  43.08 
 
 		 954 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  42 
 
 		 910 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  39.25 
 
 		 920 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  41.21 
 
 		 958 aa  456  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 956 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  42.24 
 
 		 927 aa  450  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  41.35 
 
 		 952 aa  449  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  41.39 
 
 		 886 aa  444  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  41.28 
 
 		 980 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 		 939 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 881 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  39.7 
 
 		 962 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  39.7 
 
 		 958 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  39.7 
 
 		 962 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  41.26 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  41.99 
 
 		 922 aa  426  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  42 
 
 		 952 aa  427  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  43.75 
 
 		 852 aa  420  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  39.29 
 
 		 923 aa  393  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  29.91 
 
 		 2652 aa  364  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  37.44 
 
 		 942 aa  363  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  37.67 
 
 		 893 aa  359  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  36.07 
 
 		 891 aa  332  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  35.67 
 
 		 944 aa  320  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  33.66 
 
 		 928 aa  313  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.9 
 
 		 1976 aa  239  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 2032 aa  116  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 2031 aa  109  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 3320 aa  108  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1825 aa  108  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1825 aa  108  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 2031 aa  108  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.44 
 
 		 2031 aa  107  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1806 aa  106  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1126 aa  105  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1488 aa  104  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  23.67 
 
 		 2059 aa  100  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1140 aa  99.4  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  23.4 
 
 		 2035 aa  97.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  35.75 
 
 		 334 aa  85.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  22.32 
 
 		 2017 aa  82  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 2003 aa  79  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.96 
 
 		 2076 aa  73.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.7 
 
 		 1464 aa  73.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1433 aa  73.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1834 aa  73.2  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.52 
 
 		 3456 aa  72.8  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.79 
 
 		 1140 aa  72.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.2 
 
 		 2096 aa  71.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.68 
 
 		 1362 aa  71.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.98 
 
 		 3027 aa  68.6  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1753 aa  67  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  25.79 
 
 		 2194 aa  65.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  20.16 
 
 		 1328 aa  65.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.26 
 
 		 903 aa  64.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 628 aa  64.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  23.72 
 
 		 2290 aa  63.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.54 
 
 		 1381 aa  63.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  63.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 2286 aa  63.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.06 
 
 		 1271 aa  63.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1008 aa  63.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1008 aa  63.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.37 
 
 		 1467 aa  63.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  41.86 
 
 		 1935 aa  62.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.69 
 
 		 1599 aa  62.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.38 
 
 		 2094 aa  60.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.78 
 
 		 2035 aa  60.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  40.23 
 
 		 119 aa  58.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1623 aa  58.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.85 
 
 		 1710 aa  57.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.51 
 
 		 1527 aa  57.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>