46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0161 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  38.33 
 
 		 1540 aa  983    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  36.63 
 
 		 1446 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  38.33 
 
 		 1540 aa  983    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  35.42 
 
 		 1447 aa  830    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  47.56 
 
 		 1489 aa  1330    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  33.4 
 
 		 2417 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  100 
 
 		 1485 aa  3050    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  39.75 
 
 		 1528 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  33.4 
 
 		 2458 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1488 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  46.49 
 
 		 1496 aa  1293    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  38.33 
 
 		 1540 aa  983    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  47.78 
 
 		 1505 aa  1359    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  27.92 
 
 		 2558 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  29.16 
 
 		 2510 aa  502  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  29.64 
 
 		 2479 aa  496  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.18 
 
 		 2443 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  28.76 
 
 		 2554 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.21 
 
 		 2652 aa  356  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  26.37 
 
 		 2534 aa  356  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.75 
 
 		 1976 aa  269  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  27.1 
 
 		 2698 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 2032 aa  129  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 2031 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1825 aa  112  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1825 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 2031 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  24.88 
 
 		 2031 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1806 aa  108  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  28.24 
 
 		 2059 aa  80.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  27.76 
 
 		 2035 aa  77  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  28.5 
 
 		 3456 aa  74.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  74.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  53.12 
 
 		 103 aa  65.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  27.46 
 
 		 583 aa  56.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 2283 aa  53.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 2401 aa  52.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 2437 aa  52.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1328 aa  52.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  32.53 
 
 		 2165 aa  49.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.26 
 
 		 2094 aa  49.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1517 aa  49.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  36.76 
 
 		 3320 aa  48.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 2402 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 		 1282 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  19.53 
 
 		 2413 aa  45.8  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>