48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0414 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  39.53 
 
 		 1446 aa  861    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  40.19 
 
 		 1447 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  34.02 
 
 		 2417 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  47.78 
 
 		 1485 aa  1359    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  41.09 
 
 		 1528 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  34.02 
 
 		 2458 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1488 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  37.79 
 
 		 1540 aa  1001    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  88.35 
 
 		 1489 aa  2763    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  81.42 
 
 		 1496 aa  2555    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  37.79 
 
 		 1540 aa  1001    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  100 
 
 		 1505 aa  3128    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  37.79 
 
 		 1540 aa  1001    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.63 
 
 		 2510 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  29.88 
 
 		 2554 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  31.62 
 
 		 2479 aa  499  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.99 
 
 		 2443 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  31.86 
 
 		 2558 aa  486  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.55 
 
 		 2652 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  27.9 
 
 		 2534 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  26.33 
 
 		 2698 aa  255  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.93 
 
 		 1976 aa  234  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.01 
 
 		 2032 aa  165  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.05 
 
 		 2031 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1825 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1825 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  22.95 
 
 		 2031 aa  130  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 2031 aa  129  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1806 aa  129  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  30.88 
 
 		 2059 aa  81.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  30.29 
 
 		 2035 aa  76.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  20.7 
 
 		 1328 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  31.38 
 
 		 3456 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  26.24 
 
 		 583 aa  57.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  36.92 
 
 		 103 aa  56.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.94 
 
 		 1838 aa  54.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  30.2 
 
 		 2165 aa  54.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  32 
 
 		 2075 aa  53.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.6 
 
 		 472 aa  52.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.18 
 
 		 2094 aa  52  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  22.37 
 
 		 2807 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 2437 aa  46.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1289 aa  46.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 2283 aa  46.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 2401 aa  46.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  22.99 
 
 		 2513 aa  45.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 3320 aa  45.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>