45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1182 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  38.35 
 
 
1540 aa  970    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  37.89 
 
 
1446 aa  916    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  90.51 
 
 
1489 aa  2794    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  37.97 
 
 
1447 aa  911    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  100 
 
 
1496 aa  3101    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  34.28 
 
 
2417 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  46.49 
 
 
1485 aa  1293    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  40.66 
 
 
1528 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  34.27 
 
 
2458 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  34.81 
 
 
1488 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  38.35 
 
 
1540 aa  970    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  81.42 
 
 
1505 aa  2555    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  38.35 
 
 
1540 aa  970    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  31.41 
 
 
2510 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  32.23 
 
 
2479 aa  503  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  31.12 
 
 
2443 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  30.43 
 
 
2554 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  31.41 
 
 
2558 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.19 
 
 
2652 aa  427  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  27.17 
 
 
2534 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  25.51 
 
 
2698 aa  264  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  26.85 
 
 
1976 aa  241  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.79 
 
 
2032 aa  164  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.97 
 
 
2031 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.41 
 
 
1825 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.41 
 
 
1825 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.71 
 
 
2031 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.56 
 
 
2031 aa  135  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.09 
 
 
1806 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  22.53 
 
 
2059 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  22.26 
 
 
2035 aa  98.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  48.1 
 
 
119 aa  81.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  34.04 
 
 
3456 aa  73.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 
1328 aa  66.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  26.37 
 
 
583 aa  55.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  39.34 
 
 
103 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.59 
 
 
2094 aa  52.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  26.26 
 
 
2165 aa  51.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  30.4 
 
 
2075 aa  50.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 
2283 aa  49.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 
2437 aa  49.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 
2401 aa  49.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  38.24 
 
 
3320 aa  46.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.31 
 
 
2117 aa  45.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.47 
 
 
2513 aa  45.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.139311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>