37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0175 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  38.52 
 
 		 1446 aa  929    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  38.16 
 
 		 1540 aa  925    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  41.69 
 
 		 1489 aa  1051    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  40.66 
 
 		 1496 aa  1016    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  38.16 
 
 		 1540 aa  925    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  41.09 
 
 		 1505 aa  1045    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  38.16 
 
 		 1540 aa  925    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1488 aa  723    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  100 
 
 		 1528 aa  3123    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  36.47 
 
 		 2458 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  38.47 
 
 		 1447 aa  931    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  36.47 
 
 		 2417 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  39.75 
 
 		 1485 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  29.87 
 
 		 2554 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  30.23 
 
 		 2558 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.38 
 
 		 2510 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  30.7 
 
 		 2479 aa  503  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  29.51 
 
 		 2443 aa  493  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  29.11 
 
 		 2652 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2534 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  26.72 
 
 		 2698 aa  294  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.12 
 
 		 1976 aa  247  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 2031 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 2031 aa  115  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 2032 aa  115  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1825 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1825 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.7 
 
 		 2031 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  24.03 
 
 		 2059 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  23.63 
 
 		 2035 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1806 aa  105  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  27.16 
 
 		 3456 aa  69.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  57.63 
 
 		 103 aa  68.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  68.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1328 aa  55.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  20.98 
 
 		 2094 aa  55.5  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 1282 aa  49.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>