More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0998 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  33.04 
 
 		 2652 aa  1152    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  35.59 
 
 		 2443 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  32.03 
 
 		 2534 aa  709    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  35.14 
 
 		 2510 aa  802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  33.2 
 
 		 2479 aa  1125    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  71.46 
 
 		 2554 aa  3727    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2558 aa  5312    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  30.23 
 
 		 1528 aa  613  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  31.61 
 
 		 1447 aa  607  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  30.62 
 
 		 1446 aa  589  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  29.93 
 
 		 2698 aa  577  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  27.92 
 
 		 1485 aa  553  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  29.41 
 
 		 2417 aa  516  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  29.29 
 
 		 2458 aa  516  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  31.86 
 
 		 1505 aa  506  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  31.56 
 
 		 1489 aa  503  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  31.41 
 
 		 1496 aa  495  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  30.3 
 
 		 1540 aa  487  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  30.3 
 
 		 1540 aa  487  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  30.3 
 
 		 1540 aa  487  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1488 aa  451  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.88 
 
 		 1976 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  32.8 
 
 		 927 aa  336  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  33.48 
 
 		 910 aa  334  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  33.43 
 
 		 921 aa  334  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  33.69 
 
 		 881 aa  330  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  33.43 
 
 		 929 aa  330  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  32.39 
 
 		 886 aa  329  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  33.19 
 
 		 958 aa  327  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  33.43 
 
 		 952 aa  328  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  31.77 
 
 		 989 aa  325  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  33.14 
 
 		 952 aa  322  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  32.53 
 
 		 920 aa  321  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  32.25 
 
 		 955 aa  321  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  33.28 
 
 		 980 aa  320  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  33.28 
 
 		 994 aa  319  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  31.99 
 
 		 940 aa  316  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  32.07 
 
 		 952 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  30.32 
 
 		 956 aa  306  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  31.69 
 
 		 939 aa  304  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  32.55 
 
 		 954 aa  303  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  32.55 
 
 		 954 aa  303  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  32.55 
 
 		 954 aa  303  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  32.89 
 
 		 922 aa  300  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  33.14 
 
 		 852 aa  297  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  31.43 
 
 		 891 aa  288  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  32.17 
 
 		 962 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  32.17 
 
 		 958 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  32.17 
 
 		 962 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 923 aa  283  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  29.83 
 
 		 942 aa  278  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  28.77 
 
 		 893 aa  255  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  29.53 
 
 		 944 aa  249  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  26.97 
 
 		 928 aa  241  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1825 aa  190  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1825 aa  190  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1806 aa  190  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 2031 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 2031 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  28.9 
 
 		 2031 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.38 
 
 		 2032 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1488 aa  125  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1140 aa  125  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1126 aa  121  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.14 
 
 		 3456 aa  112  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  28.38 
 
 		 2035 aa  97.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  28.38 
 
 		 2059 aa  96.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.32 
 
 		 2096 aa  92.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  51.9 
 
 		 119 aa  90.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.26 
 
 		 2035 aa  87.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  33.83 
 
 		 3320 aa  85.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1328 aa  84.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  21.74 
 
 		 1433 aa  84.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1352 aa  84  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1338 aa  80.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.9 
 
 		 2017 aa  79  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  22.07 
 
 		 1599 aa  77.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  21.7 
 
 		 2094 aa  77  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  21.13 
 
 		 1429 aa  77  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.71 
 
 		 2762 aa  76.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  56.45 
 
 		 103 aa  76.3  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  27.41 
 
 		 1681 aa  75.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1834 aa  75.5  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  22.36 
 
 		 690 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  31.73 
 
 		 1935 aa  75.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1600 aa  73.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.07 
 
 		 1595 aa  72.8  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  22.68 
 
 		 931 aa  72  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 628 aa  72  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.13 
 
 		 1586 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  21.93 
 
 		 927 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  33.04 
 
 		 1464 aa  69.7  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  20.73 
 
 		 903 aa  68.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  23.94 
 
 		 1053 aa  68.6  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1409 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1959 aa  68.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  39.09 
 
 		 316 aa  67.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.09 
 
 		 1576 aa  67.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  39.09 
 
 		 298 aa  67.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1386 aa  67  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>