More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1189 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  53.76 
 
 		 954 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  52.5 
 
 		 962 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  91.62 
 
 		 910 aa  1251    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  53.76 
 
 		 954 aa  676    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  74.82 
 
 		 958 aa  1405    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  53.76 
 
 		 954 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  51.71 
 
 		 994 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  100 
 
 		 952 aa  1965    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  90.55 
 
 		 921 aa  1255    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  52.82 
 
 		 852 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  52.97 
 
 		 958 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  52.5 
 
 		 962 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  87.68 
 
 		 929 aa  1288    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  86.97 
 
 		 952 aa  1653    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  51.87 
 
 		 980 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  47.14 
 
 		 952 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  45.77 
 
 		 989 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  43.13 
 
 		 940 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  43.5 
 
 		 955 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  41.9 
 
 		 920 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  43.01 
 
 		 881 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.51 
 
 		 2417 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.35 
 
 		 2458 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  41.74 
 
 		 956 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  41.6 
 
 		 939 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  40.34 
 
 		 886 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  41.1 
 
 		 927 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  41.64 
 
 		 923 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  37.48 
 
 		 922 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  37.91 
 
 		 942 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  37.81 
 
 		 893 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  37.42 
 
 		 944 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  37.65 
 
 		 891 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  35.42 
 
 		 928 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.14 
 
 		 2558 aa  350  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.93 
 
 		 2554 aa  343  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.31 
 
 		 2698 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  31.08 
 
 		 2534 aa  268  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  29.81 
 
 		 2652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.35 
 
 		 2443 aa  261  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.14 
 
 		 2510 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  29.21 
 
 		 2479 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  40.33 
 
 		 334 aa  149  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.19 
 
 		 1976 aa  109  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1126 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 3320 aa  98.2  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  27.92 
 
 		 1338 aa  94.4  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1935 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 927 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.93 
 
 		 2145 aa  84  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  43.27 
 
 		 1464 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.78 
 
 		 690 aa  82  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 2003 aa  81.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.64 
 
 		 2017 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1409 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 3193 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.74 
 
 		 903 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.9 
 
 		 1384 aa  77.4  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.48 
 
 		 2076 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 867 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1147 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1527 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1400 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1386 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1600 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.39 
 
 		 1140 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.92 
 
 		 1381 aa  73.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  23.43 
 
 		 1560 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.93 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1352 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  34.78 
 
 		 1892 aa  72  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  23.76 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.11 
 
 		 1673 aa  71.2  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  37.78 
 
 		 3456 aa  71.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1917 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  22 
 
 		 1834 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1547 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1554 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.34 
 
 		 2731 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  24.76 
 
 		 583 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1550 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.61 
 
 		 1577 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.93 
 
 		 1385 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  33.48 
 
 		 909 aa  69.3  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1551 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1390 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.55 
 
 		 1348 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 628 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.49 
 
 		 1271 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1433 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 1602 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.89 
 
 		 2096 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.91 
 
 		 1359 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1402 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  26.82 
 
 		 931 aa  67  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  30.29 
 
 		 972 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.24 
 
 		 2138 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>