More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2699 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  100 
 
 		 1892 aa  3774    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  31.97 
 
 		 1338 aa  523  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.42 
 
 		 1467 aa  208  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  22.92 
 
 		 927 aa  147  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  34.96 
 
 		 1381 aa  139  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1547 aa  136  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.47 
 
 		 1917 aa  136  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.18 
 
 		 903 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1602 aa  133  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.41 
 
 		 1614 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.84 
 
 		 1485 aa  127  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.75 
 
 		 1577 aa  125  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.35 
 
 		 889 aa  125  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1586 aa  122  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 913 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 690 aa  120  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1611 aa  119  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1411 aa  119  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.16 
 
 		 1271 aa  119  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.26 
 
 		 1429 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1531 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1527 aa  118  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2450  RHS protein  36.45 
 
 		 414 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.15 
 
 		 1981 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.02 
 
 		 1409 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1433 aa  116  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  23.54 
 
 		 764 aa  115  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1177 aa  115  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  23.51 
 
 		 741 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1620 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.37 
 
 		 1639 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.99 
 
 		 2096 aa  113  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1189 aa  112  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1518 aa  112  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1419 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1554 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1604 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1397 aa  109  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.56 
 
 		 1508 aa  109  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  24.39 
 
 		 705 aa  108  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.67 
 
 		 3027 aa  107  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.37 
 
 		 1385 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 867 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1400 aa  107  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  42.31 
 
 		 605 aa  106  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1411 aa  106  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  23.04 
 
 		 1397 aa  105  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1377 aa  105  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  32.14 
 
 		 1359 aa  105  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.3 
 
 		 1446 aa  104  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  33.48 
 
 		 1390 aa  103  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1541 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.91 
 
 		 451 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1541 aa  103  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  22.5 
 
 		 1397 aa  103  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1541 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  22.57 
 
 		 1411 aa  102  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1198 aa  102  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.73 
 
 		 1348 aa  102  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  22.34 
 
 		 738 aa  101  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  31.17 
 
 		 788 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  31.17 
 
 		 788 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.05 
 
 		 866 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1317 aa  101  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1541 aa  100  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1541 aa  100  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1541 aa  100  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1381 aa  100  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  32.02 
 
 		 423 aa  100  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  31.75 
 
 		 1489 aa  99.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 508 aa  99.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1319 aa  99  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1386 aa  99  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.23 
 
 		 1840 aa  98.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.34 
 
 		 1528 aa  98.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  29.55 
 
 		 917 aa  98.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.93 
 
 		 1509 aa  97.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  30.56 
 
 		 1572 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  27.69 
 
 		 480 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1466 aa  96.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 693 aa  95.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1553 aa  95.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1492 aa  96.3  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  20.45 
 
 		 2035 aa  95.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  34.04 
 
 		 1568 aa  95.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.2 
 
 		 1942 aa  94.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  44.85 
 
 		 1379 aa  94.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  31.54 
 
 		 1586 aa  94  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  34.91 
 
 		 1576 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  33.76 
 
 		 924 aa  94  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1551 aa  94  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  32.84 
 
 		 414 aa  93.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  31.54 
 
 		 1595 aa  93.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 561 aa  92.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  34.72 
 
 		 502 aa  92.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  34.57 
 
 		 1410 aa  92.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  27.22 
 
 		 920 aa  92  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  21.39 
 
 		 1600 aa  92  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  36 
 
 		 312 aa  92  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  28.14 
 
 		 583 aa  92  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>