284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0604 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  72.97 
 
 
962 aa  1066    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  72.97 
 
 
958 aa  1066    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  100 
 
 
954 aa  1962    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  83.19 
 
 
994 aa  1169    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  53.76 
 
 
952 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  53.05 
 
 
952 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  100 
 
 
954 aa  1962    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  53.68 
 
 
921 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  53.03 
 
 
958 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  72.97 
 
 
962 aa  1066    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  75.51 
 
 
980 aa  1061    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  53.26 
 
 
952 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  53.75 
 
 
910 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  100 
 
 
954 aa  1962    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  80 
 
 
852 aa  1125    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  53.47 
 
 
929 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  44.54 
 
 
989 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  43.08 
 
 
2458 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  43.17 
 
 
2417 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  41.54 
 
 
940 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  40.11 
 
 
955 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  39.31 
 
 
956 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  39.97 
 
 
939 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  42.06 
 
 
881 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  38.98 
 
 
920 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  39.02 
 
 
886 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  38.83 
 
 
927 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  38.56 
 
 
922 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  38.47 
 
 
923 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  74.9 
 
 
334 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  35.84 
 
 
893 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  36.05 
 
 
891 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  35.25 
 
 
942 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  34.24 
 
 
944 aa  324  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  32.55 
 
 
2558 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  32.85 
 
 
2554 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.69 
 
 
928 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.39 
 
 
2698 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  29.67 
 
 
2534 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.94 
 
 
2652 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.21 
 
 
2510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.44 
 
 
2443 aa  218  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.19 
 
 
2479 aa  185  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 
3320 aa  112  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 
1126 aa  111  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 
1488 aa  100  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 
1140 aa  97.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26.32 
 
 
3456 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25 
 
 
1600 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.81 
 
 
1976 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  42 
 
 
1935 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  39.42 
 
 
1464 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.11 
 
 
2017 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 
1520 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25 
 
 
2076 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.9 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 
1547 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 
1550 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.54 
 
 
1834 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 
598 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  37.3 
 
 
1338 aa  65.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.08 
 
 
2145 aa  64.3  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  28.16 
 
 
1912 aa  64.3  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.85 
 
 
1560 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.71 
 
 
1599 aa  64.3  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  23.81 
 
 
583 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  37.86 
 
 
1348 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.81 
 
 
1551 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.81 
 
 
1577 aa  63.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 
3193 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.67 
 
 
1673 aa  62.4  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  34.43 
 
 
1710 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 
1433 aa  62.4  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1527 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 
605 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.47 
 
 
1429 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  36.67 
 
 
1620 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 
2003 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 
2294 aa  60.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.73 
 
 
1147 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.28 
 
 
1467 aa  60.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 
1531 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.77 
 
 
1400 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.37 
 
 
1639 aa  60.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 
1791 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  22.32 
 
 
1854 aa  59.7  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  23.9 
 
 
1140 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  34.55 
 
 
414 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 
1386 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.51 
 
 
1411 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 
480 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  25.19 
 
 
931 aa  58.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  27.65 
 
 
316 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  30.08 
 
 
1381 aa  58.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25.06 
 
 
2290 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.67 
 
 
1609 aa  58.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  28.64 
 
 
867 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.34 
 
 
1573 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.04 
 
 
678 aa  58.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.31 
 
 
1626 aa  58.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>