220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1675 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  98.74 
 
 		 715 aa  1480    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 715 aa  1504    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  80.06 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  77.85 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  78.16 
 
 		 393 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  53.61 
 
 		 407 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  54.57 
 
 		 384 aa  343  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  55.38 
 
 		 395 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  52.87 
 
 		 399 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  54.13 
 
 		 398 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  47.47 
 
 		 404 aa  332  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  53.58 
 
 		 398 aa  326  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  51.19 
 
 		 410 aa  324  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  50.45 
 
 		 409 aa  318  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  50.91 
 
 		 402 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  49.85 
 
 		 408 aa  316  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  49.55 
 
 		 408 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  50.77 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  49.25 
 
 		 408 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  50 
 
 		 395 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  49.4 
 
 		 408 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  50.6 
 
 		 408 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  49.13 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  49.25 
 
 		 408 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  49.25 
 
 		 408 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  49.25 
 
 		 408 aa  313  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  49.25 
 
 		 408 aa  313  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  50.77 
 
 		 394 aa  312  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  48.65 
 
 		 405 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  48.65 
 
 		 405 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  49.39 
 
 		 409 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  48.77 
 
 		 395 aa  310  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  48.65 
 
 		 405 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  50.9 
 
 		 410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  48.69 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  49.54 
 
 		 397 aa  308  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  47.11 
 
 		 398 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  51.52 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  49.24 
 
 		 406 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  46.85 
 
 		 411 aa  301  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  46.55 
 
 		 411 aa  300  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  50.45 
 
 		 412 aa  300  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  50.62 
 
 		 398 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  48.18 
 
 		 406 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  49.09 
 
 		 406 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  48.95 
 
 		 411 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  49.54 
 
 		 401 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  49.1 
 
 		 404 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  48.02 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  48.65 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  47.11 
 
 		 409 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  48.48 
 
 		 407 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  48.79 
 
 		 408 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  47.9 
 
 		 407 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  49.25 
 
 		 407 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  47.9 
 
 		 407 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  47.58 
 
 		 407 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  48.79 
 
 		 404 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  46.97 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  46.58 
 
 		 385 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  44.72 
 
 		 388 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  44.69 
 
 		 390 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  43.65 
 
 		 388 aa  264  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  45.65 
 
 		 389 aa  264  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  44.44 
 
 		 384 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  40.12 
 
 		 396 aa  211  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  35.51 
 
 		 372 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  34.56 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  38.97 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  38.11 
 
 		 475 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  40.07 
 
 		 470 aa  153  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  37.74 
 
 		 463 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  35.17 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  35.08 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  36.27 
 
 		 470 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  34.43 
 
 		 508 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  29.01 
 
 		 963 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  33.21 
 
 		 400 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  31.09 
 
 		 391 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  29.65 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  34.12 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  30.91 
 
 		 379 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  33.03 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  34.7 
 
 		 440 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  30.12 
 
 		 408 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  36.21 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  28.95 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  28.72 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  29.97 
 
 		 486 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  33.45 
 
 		 473 aa  125  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  31.16 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  27.47 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1375  protein of unknown function UPF0027  28.57 
 
 		 405 aa  122  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0018523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  27.59 
 
 		 447 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.44 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  30.12 
 
 		 391 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  27.9 
 
 		 488 aa  120  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  29.72 
 
 		 480 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3237  gp160  32.03 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2963  hypothetical protein  29.54 
 
 		 349 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>