216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5290 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  914    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  57.37 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  54.74 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 		 409 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  49 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  50.5 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  35.89 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  36.54 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  37.18 
 
 		 470 aa  206  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  35.68 
 
 		 508 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  34.11 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  33.17 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  35.88 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  33.93 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  35.01 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  37.04 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  36.22 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  33.95 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  32.6 
 
 		 462 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  32.99 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  29.44 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  31.81 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.03 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  33.77 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  31.22 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  32.04 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  32.21 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  32.56 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  33.52 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  33.81 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  32.47 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  32.47 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  32.97 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  34.71 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  32.82 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  30.83 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  31.81 
 
 		 406 aa  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  32.25 
 
 		 406 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  31.17 
 
 		 428 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.57 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  31.58 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  32.89 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  32.67 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.17 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  30.29 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.37 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.34 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  30 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.83 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  29.45 
 
 		 482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  28.83 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  28.2 
 
 		 443 aa  146  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  28 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.08 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  32.77 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  31.3 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  30.31 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.32 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  28.5 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  31.13 
 
 		 404 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  27.75 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.49 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  31.93 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  28.61 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  30.28 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  31.79 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  28 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  30.42 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  29.56 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.08 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  27.73 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  27.73 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  27.73 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  27.73 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  27.73 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  27.73 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.73 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  28.85 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  28.42 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  29.44 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  27.47 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.3 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  30.79 
 
 		 500 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  27.47 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  29.28 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  29.22 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  29.43 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  31.36 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  30.25 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  27.71 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  28.16 
 
 		 493 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  29.16 
 
 		 480 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  28.92 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  28.77 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  29.4 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  31.73 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  30.7 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  28.54 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>