218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0235 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 406 aa  840    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  69.8 
 
 		 409 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  68.32 
 
 		 409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  68.64 
 
 		 407 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  68.64 
 
 		 407 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  68.64 
 
 		 407 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  64.37 
 
 		 411 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  67.41 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  64.04 
 
 		 411 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  64.6 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  67.41 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  67.16 
 
 		 411 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  65.19 
 
 		 406 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  67.01 
 
 		 404 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  62.81 
 
 		 405 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  67.51 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  62.56 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  66.5 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  62.56 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  62.56 
 
 		 408 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  66.24 
 
 		 408 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  62.32 
 
 		 408 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  65.4 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  62.32 
 
 		 408 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  62.07 
 
 		 408 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  62.32 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  62.32 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  61.82 
 
 		 408 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  64.94 
 
 		 407 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  61.82 
 
 		 408 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  61.08 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  62.56 
 
 		 407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  62.5 
 
 		 410 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  62.66 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  61.75 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  58.5 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  57.46 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  58.5 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  58.25 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  52.33 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  52.64 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  51.33 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  50 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 		 393 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  49.62 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  51.49 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  50.99 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  50.92 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  50.74 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  50.99 
 
 		 409 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  48.53 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  48.77 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  51.42 
 
 		 389 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  49.74 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  49.61 
 
 		 390 aa  348  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  49.62 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  47.8 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  47.42 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  48.11 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  50.51 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  46.39 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  46.81 
 
 		 407 aa  316  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  48.18 
 
 		 715 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  48.18 
 
 		 715 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  40.79 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  34.28 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  38.11 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  33.76 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  31.8 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.84 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  35.38 
 
 		 470 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.44 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  30.7 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  33.56 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  32.32 
 
 		 462 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  32.82 
 
 		 508 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  30.79 
 
 		 498 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  29.52 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  32.95 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  34.25 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  30.96 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 		 512 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  28.73 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  34.64 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  32.25 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.21 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  31.43 
 
 		 486 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  30.7 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  28.79 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  31.03 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.47 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  28.54 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  30.11 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  31.34 
 
 		 375 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  30.05 
 
 		 480 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  32.25 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  31.61 
 
 		 484 aa  152  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28 
 
 		 472 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  31.52 
 
 		 371 aa  152  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>