218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3720 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  87.99 
 
 
408 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  87.99 
 
 
408 aa  758    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  73.02 
 
 
406 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  72.52 
 
 
411 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  73.15 
 
 
411 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  88.48 
 
 
408 aa  763    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  99.01 
 
 
405 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  87.25 
 
 
408 aa  752    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  87.99 
 
 
408 aa  759    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  100 
 
 
405 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  87.5 
 
 
408 aa  755    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  98.77 
 
 
405 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  87.99 
 
 
408 aa  758    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  87.75 
 
 
408 aa  756    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  87.99 
 
 
408 aa  758    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  71.71 
 
 
409 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  70.54 
 
 
407 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  70.22 
 
 
409 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  70.74 
 
 
408 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  70.48 
 
 
404 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  68.72 
 
 
428 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  68.72 
 
 
407 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  70.23 
 
 
404 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  68.72 
 
 
407 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  69.75 
 
 
401 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  68.23 
 
 
407 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  68.4 
 
 
407 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  68.15 
 
 
411 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  64.78 
 
 
412 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  65.59 
 
 
407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  64.15 
 
 
410 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  62.59 
 
 
430 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  62.81 
 
 
406 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  64.21 
 
 
409 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  57.01 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  56.86 
 
 
406 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  54.68 
 
 
398 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  54.43 
 
 
398 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  53.81 
 
 
398 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  53.88 
 
 
398 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  49.28 
 
 
393 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  49.76 
 
 
395 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  49.15 
 
 
393 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  51.05 
 
 
393 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  50 
 
 
395 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  50.51 
 
 
384 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  48.4 
 
 
407 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  48.57 
 
 
398 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  49.39 
 
 
399 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  49.22 
 
 
389 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  47.28 
 
 
395 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  48.83 
 
 
388 aa  355  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  46.42 
 
 
397 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  47.87 
 
 
402 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  45.76 
 
 
388 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  47.39 
 
 
409 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  46.6 
 
 
395 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  46.42 
 
 
410 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  46.37 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  45.41 
 
 
390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  46.49 
 
 
384 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  45.79 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  44.86 
 
 
394 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  48.65 
 
 
715 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  48.65 
 
 
715 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  42.86 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  34.42 
 
 
372 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  34.68 
 
 
470 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  33.17 
 
 
462 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  35.1 
 
 
473 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.42 
 
 
463 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  34.1 
 
 
512 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.59 
 
 
508 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  35.05 
 
 
399 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  31.71 
 
 
391 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  33.5 
 
 
475 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  33.61 
 
 
375 aa  172  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  30.96 
 
 
488 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  31.26 
 
 
486 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  30.29 
 
 
395 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  33.5 
 
 
474 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  31.94 
 
 
488 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  29.74 
 
 
395 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.01 
 
 
470 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  34.88 
 
 
484 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  30.29 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  29.26 
 
 
395 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  29.26 
 
 
395 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  29.74 
 
 
395 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  29.74 
 
 
395 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  30.54 
 
 
498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  29.09 
 
 
396 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  32.01 
 
 
480 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  29.89 
 
 
484 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  31.78 
 
 
480 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  29.89 
 
 
484 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  31.78 
 
 
480 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  30.65 
 
 
478 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  32.52 
 
 
440 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  32.13 
 
 
439 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>