220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0250 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  807    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  64.5 
 
 		 400 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  65.64 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  61.87 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  61.11 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  61.11 
 
 		 395 aa  524  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  61.62 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  61.11 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  60.61 
 
 		 395 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  60.61 
 
 		 395 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2963  hypothetical protein  56.62 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3237  gp160  56.51 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  47.12 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  43.67 
 
 		 371 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  44.92 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2099  protein of unknown function UPF0027  42.06 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  42.72 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1375  protein of unknown function UPF0027  42.61 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0018523  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4093  protein of unknown function UPF0027  33.13 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1132  protein of unknown function UPF0027  32.57 
 
 		 482 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3106  protein of unknown function UPF0027  31.87 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0158  protein of unknown function UPF0027  37.86 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  32.51 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.25 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  31.99 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  31.51 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  31.18 
 
 		 404 aa  186  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  29.74 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  31.77 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.75 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  30.89 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.89 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  31.22 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  30.4 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  32.36 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.23 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  29.59 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  29.31 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  33.51 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  29.86 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  30.51 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  29.82 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  30.36 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  29.89 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  31.89 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  29.22 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  30.68 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  30.55 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  30 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  30 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.76 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.74 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.09 
 
 		 408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  29.33 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.33 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.27 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  31.33 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  29.76 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.52 
 
 		 408 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  28.76 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  29.09 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  30.81 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  28.64 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  32.01 
 
 		 409 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  29.52 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  30.64 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  28.92 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.52 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  29.29 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  30.5 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  28.87 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  28.23 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  28.47 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  28.71 
 
 		 407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  28.71 
 
 		 407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  29.19 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  28.33 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  29.02 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  27.25 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  27.21 
 
 		 407 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  27.99 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  28.47 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  27.82 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  30.69 
 
 		 463 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2898  protein of unknown function UPF0027  27.49 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  28.61 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  29.75 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  28.95 
 
 		 715 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  28.36 
 
 		 715 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  27.82 
 
 		 478 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  26.46 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  26.35 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3238  gp160  77.78 
 
 		 72 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  26.2 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2965  hypothetical protein  77.78 
 
 		 72 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>