220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0858 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  843    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  60.49 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  61.13 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  60.89 
 
 		 398 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  59.85 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  60.7 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  60.15 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  59.8 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  60.3 
 
 		 408 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  60.2 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  59.6 
 
 		 411 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  59.95 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  60 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  59.71 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  58.61 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  58.61 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  58.61 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  59.75 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  58.61 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  60.95 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  58.61 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  58.85 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  59.45 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  59.45 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  59.2 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  58.37 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  58.13 
 
 		 408 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  58.61 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  58.37 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  57.24 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  57.01 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  57.24 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  57.46 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  57.46 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  58.21 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  58.81 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  56.58 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  57.57 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  55.45 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  56.22 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  51.77 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  52.53 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  50.36 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  52.08 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  54.08 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  49.88 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  51.04 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  50.5 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  51.13 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  50.99 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  51.62 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  50.5 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  48.9 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  48.62 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  51.4 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  48.29 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  48.94 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  48.8 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  47.37 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  46.37 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  48.1 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  45.15 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  45.6 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  47.47 
 
 		 715 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  54.15 
 
 		 715 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  42.78 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  37.79 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  37.14 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  32.93 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  31.97 
 
 		 395 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  31.97 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  31.49 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  31.49 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  32.21 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  36.86 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  32.69 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  33.58 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  31.18 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  31.38 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.17 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  33.89 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  33.1 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  34.78 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  34.09 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  32.92 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  33.17 
 
 		 439 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  32.79 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  32.06 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  32.02 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  32.16 
 
 		 371 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  30.69 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  32.69 
 
 		 478 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  33.15 
 
 		 440 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2099  protein of unknown function UPF0027  28.24 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  31.62 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  28.37 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  28.68 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  32.27 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  28.75 
 
 		 477 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>