220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0804 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  774    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  44.24 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  42.79 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  44.09 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  44.57 
 
 		 369 aa  302  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  42.09 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2099  protein of unknown function UPF0027  40.9 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  42.79 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  42.29 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  42.29 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  42.29 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  42.04 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  42.04 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  42.29 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  39.7 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0158  protein of unknown function UPF0027  41.24 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1375  protein of unknown function UPF0027  39.45 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0018523  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4093  protein of unknown function UPF0027  32.57 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2963  hypothetical protein  41.69 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3237  gp160  42.72 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1132  protein of unknown function UPF0027  31.67 
 
 		 482 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3106  protein of unknown function UPF0027  29.61 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  33.24 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.44 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  34.51 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  34.07 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  35.59 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  33.16 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  33.25 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  32.71 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.08 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.48 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.17 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  32.35 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  35.21 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  31.31 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.73 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  33.15 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  33.61 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  33.33 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  31.46 
 
 		 384 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  32.96 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  34.04 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  31.79 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  32.07 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  32.78 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  32.18 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  31.88 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  30.49 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  31.54 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  32.43 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  31.35 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  31.02 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  32.43 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  32.43 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  32.43 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  32.43 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  31.98 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  32.43 
 
 		 408 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  32.35 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  33.14 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  32.43 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  30.69 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  29.97 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.15 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  29.68 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  32.51 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  31.34 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  31.06 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  32.16 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  32.56 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  30.68 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  30.73 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  30.33 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.33 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  32.97 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  31.3 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.15 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  32.59 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  31.27 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  31.84 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.34 
 
 		 406 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  31.61 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.26 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.43 
 
 		 409 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  30.67 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  35.45 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  31.94 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  32.95 
 
 		 475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  32.54 
 
 		 484 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  31.93 
 
 		 508 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  31.14 
 
 		 512 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  31.21 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  30.08 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  32.21 
 
 		 470 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  29.58 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  30.27 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  31.91 
 
 		 474 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>