218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5869 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  75.93 
 
 		 406 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  848    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  74.57 
 
 		 409 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  74.75 
 
 		 407 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  75.5 
 
 		 428 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  75.25 
 
 		 407 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  75.25 
 
 		 407 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  75.06 
 
 		 404 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  75.25 
 
 		 407 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  75 
 
 		 411 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  76.06 
 
 		 404 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  73.45 
 
 		 411 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  73.7 
 
 		 411 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  72.95 
 
 		 408 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  74.63 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  72.95 
 
 		 407 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  71.71 
 
 		 405 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  71.71 
 
 		 405 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  71.71 
 
 		 405 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  70.22 
 
 		 412 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  69.29 
 
 		 408 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  69.21 
 
 		 407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  69.29 
 
 		 408 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  69.29 
 
 		 408 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  69.04 
 
 		 408 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  69.29 
 
 		 408 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  69.29 
 
 		 408 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  69.04 
 
 		 408 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  68.55 
 
 		 408 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  69.04 
 
 		 408 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  67.15 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  67.4 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  68.32 
 
 		 406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  65.35 
 
 		 409 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  58.11 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  57.46 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  59.15 
 
 		 398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  58.15 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  57.14 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  54.68 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  51.11 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  52.1 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  52.44 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  48.66 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  52.04 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  52.5 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  47.19 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  51.65 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  46.96 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  50.5 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  50.51 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  50.13 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  49.5 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  49.35 
 
 		 388 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  47.95 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  49.11 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  46.08 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  48.96 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  45.97 
 
 		 384 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  46.72 
 
 		 394 aa  328  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  46.32 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  47.11 
 
 		 715 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  47.11 
 
 		 715 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  40.05 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  35.16 
 
 		 372 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  35.02 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  36.32 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  34.26 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  34.11 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  35.29 
 
 		 475 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  33.16 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  35.75 
 
 		 474 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  30.29 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  35.03 
 
 		 512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.76 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  32.01 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  34.87 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  31.19 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  30.9 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  29.65 
 
 		 396 aa  163  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.82 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  31.63 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  32.53 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  31.07 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.84 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  31.54 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  30.9 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  32.65 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  31.12 
 
 		 488 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  31.14 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  30.66 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  30.66 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  30.53 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  31.22 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>