218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1279 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 372 aa  775    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  37.79 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  40.46 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  37.67 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  38.33 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  36.67 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  38.16 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  35.31 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  35.37 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  35.77 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  35.97 
 
 		 402 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  35.13 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  34.08 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  34.99 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  36.36 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  34.87 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  34.96 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  35.07 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  36.41 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  35.81 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  34.94 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  35.19 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  36.18 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  35.31 
 
 		 408 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  35.56 
 
 		 408 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  34.87 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  34.41 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  35.06 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  34.33 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  34.55 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  35.31 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  35.31 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  35.31 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  35.31 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  35.31 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  33.51 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  35.16 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  34.67 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  34.67 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  34 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  33.08 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  31.84 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  34.42 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  35.38 
 
 		 409 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  34.55 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  34.29 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  33.08 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  34.96 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  35.34 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  35.03 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  34.28 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  36.08 
 
 		 439 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  34.78 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  33.08 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  34.51 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  35.14 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  34.11 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  33.08 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  34.96 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  36.07 
 
 		 484 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  32.26 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  32.26 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  32.01 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  32.01 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  34.94 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  32.26 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  32.01 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 512 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  31.76 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  36.11 
 
 		 475 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  33.25 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  33.86 
 
 		 478 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  31.71 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  35.51 
 
 		 715 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  35.51 
 
 		 715 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.07 
 
 		 508 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  34.13 
 
 		 473 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.45 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  30.37 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  34.03 
 
 		 470 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  32.89 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  33.42 
 
 		 474 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  29.44 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2963  hypothetical protein  33.63 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  32.12 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  34.02 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  35.25 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  30.51 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  33.83 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.26 
 
 		 443 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  28.79 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>