218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0086 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 484 aa  996    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  58.84 
 
 		 508 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  56.94 
 
 		 512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  50.72 
 
 		 475 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  51.2 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  50.32 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  48.41 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  55.81 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  47.08 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  51.79 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  52.99 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  40.78 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  42.42 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  37.97 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  36.07 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  32.18 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  32.76 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  33.77 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  32.27 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  36.08 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  33.95 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  36.62 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  35.99 
 
 		 395 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  36.04 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  34.69 
 
 		 402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  35.14 
 
 		 405 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  35.97 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  35.05 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  35.14 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  36.6 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  34.43 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  36.65 
 
 		 407 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  35.29 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  35.29 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  35.29 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  35.04 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  35.29 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  35.38 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  34.88 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  36.13 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  34.86 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  35.29 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  34.68 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  35.97 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  34.11 
 
 		 395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  33.93 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  31.52 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  33.84 
 
 		 398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  34.78 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  34.78 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  34.18 
 
 		 408 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  35.54 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  34.17 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  34.1 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  36.14 
 
 		 393 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  34.79 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  34.63 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  35.48 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  36.15 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  34.27 
 
 		 407 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  35.64 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  34.64 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  35.46 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  33.17 
 
 		 409 aa  156  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  34.96 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  34.45 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  34.1 
 
 		 407 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  34.91 
 
 		 404 aa  153  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  34.18 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  33.59 
 
 		 409 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.88 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  33.25 
 
 		 409 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  34.34 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  34.45 
 
 		 394 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  34.63 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1051  hypothetical protein  29.5 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.738167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  31.89 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  33.24 
 
 		 398 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  34.22 
 
 		 384 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  34.4 
 
 		 389 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  33.87 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1011  hypothetical protein  29.09 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  29.9 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  32.77 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  30.57 
 
 		 473 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  33.25 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  32.16 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.27 
 
 		 407 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.56 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  29.26 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  29.06 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  30.68 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  31.68 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.44 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.7 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  30.8 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  31.44 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>