218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5432 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  79.85 
 
 		 406 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  75.25 
 
 		 409 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  77.26 
 
 		 409 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  96.81 
 
 		 428 aa  819    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  95.09 
 
 		 407 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  78.66 
 
 		 404 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  95.09 
 
 		 407 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  74.57 
 
 		 411 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  94.35 
 
 		 407 aa  802    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  77.26 
 
 		 408 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  74.08 
 
 		 411 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  78.91 
 
 		 404 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  97.79 
 
 		 411 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  77 
 
 		 401 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  75.18 
 
 		 407 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  68.64 
 
 		 405 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  68.4 
 
 		 405 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  68.64 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  68.84 
 
 		 408 aa  577  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  68.64 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  67.98 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  66.75 
 
 		 408 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  66.75 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  66.75 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  66.75 
 
 		 408 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  66.75 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  66.75 
 
 		 408 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  66.75 
 
 		 408 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  66.01 
 
 		 408 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  65.85 
 
 		 410 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  67.41 
 
 		 406 aa  549  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  64.3 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  63.9 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  60 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  57.56 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  59.2 
 
 		 398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  58.92 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  57.04 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  53.55 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  53.75 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  50.85 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  52.96 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  52.42 
 
 		 384 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  53.65 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  52.53 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  48.89 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  49.26 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  48.17 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  49.15 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  50.75 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  49.87 
 
 		 397 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  50.25 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  50 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  49.48 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  47.33 
 
 		 410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  49.02 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  49.01 
 
 		 407 aa  341  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  48.45 
 
 		 384 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  45.89 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  47.29 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  49.22 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  49.25 
 
 		 715 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  49.25 
 
 		 715 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  38.94 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  35.29 
 
 		 473 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  35.44 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.15 
 
 		 470 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.16 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  31.81 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  36.57 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  35.43 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  33.67 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  30.02 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  35.38 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  34.78 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  28.98 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  29.97 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  28.23 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  28.78 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  28.78 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  28.23 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  28.88 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  31.35 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  28.78 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.05 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  31.26 
 
 		 484 aa  155  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  31.07 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  32.82 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  30.31 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.89 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  32.43 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  31.76 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  29.42 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  31.76 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.16 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28.96 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>