218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0293 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  99.75 
 
 		 408 aa  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  99.51 
 
 		 408 aa  853    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  99.02 
 
 		 408 aa  851    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  98.28 
 
 		 408 aa  845    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  857    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  88.24 
 
 		 405 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  88.24 
 
 		 405 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  99.75 
 
 		 408 aa  854    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  87.99 
 
 		 405 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  98.77 
 
 		 408 aa  847    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  100 
 
 		 408 aa  857    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  98.28 
 
 		 408 aa  845    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  71.81 
 
 		 411 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  71.81 
 
 		 406 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  71.08 
 
 		 411 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  70.76 
 
 		 409 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  69.36 
 
 		 407 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  70.27 
 
 		 408 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  69.04 
 
 		 409 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  70.28 
 
 		 404 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  69.77 
 
 		 404 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  70.28 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  66.83 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  66.83 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  66.83 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  66.75 
 
 		 407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  66.34 
 
 		 407 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  66.5 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  66.42 
 
 		 407 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  65.44 
 
 		 412 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  64.34 
 
 		 410 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  63.44 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  62.32 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  64.07 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  58.61 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  55.69 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 398 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  54.63 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  53.16 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  54.39 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  50.48 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  49.51 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  49.39 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  49.28 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  49.04 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  49.16 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  49.26 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  50.25 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  47.79 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  48.19 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  49.74 
 
 		 389 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  46.62 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  47.15 
 
 		 402 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  47.57 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  46.65 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  49.21 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  46.63 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  45.28 
 
 		 410 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  45.9 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  46.58 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  46.27 
 
 		 384 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  45.16 
 
 		 394 aa  325  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  49.25 
 
 		 715 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  49.25 
 
 		 715 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  44.5 
 
 		 407 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  41.71 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  35.31 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  32.84 
 
 		 470 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  35.06 
 
 		 473 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  34.31 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  35.38 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  33.17 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  31.67 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  34.41 
 
 		 512 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.67 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  34.58 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  31.12 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  30.95 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  30.95 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  31.11 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  29.98 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  31.25 
 
 		 486 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  35.29 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  30.49 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  32.35 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  29.55 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  32.15 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  30.7 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  31.68 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  32.43 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  31.44 
 
 		 480 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  30.66 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  31 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  30.19 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  30.87 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>