219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2615 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 
369 aa  765    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  47.96 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  46.21 
 
 
391 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  45.18 
 
 
396 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  43.37 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  43.22 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  43.22 
 
 
395 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  42.49 
 
 
395 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  43.22 
 
 
395 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  42.71 
 
 
395 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  42.71 
 
 
395 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  42.71 
 
 
395 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  44.57 
 
 
375 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2099  protein of unknown function UPF0027  37.23 
 
 
421 aa  275  7e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  40.58 
 
 
379 aa  275  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2963  hypothetical protein  41.55 
 
 
349 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3237  gp160  41.27 
 
 
319 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0158  protein of unknown function UPF0027  40.51 
 
 
387 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1375  protein of unknown function UPF0027  35.56 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0018523  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  33.93 
 
 
410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  33.86 
 
 
396 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  35.25 
 
 
372 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  33.33 
 
 
395 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  34.31 
 
 
397 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  33.16 
 
 
385 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.81 
 
 
384 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  33.08 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  32.56 
 
 
388 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  31.81 
 
 
394 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  32.72 
 
 
388 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  31.62 
 
 
404 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  32.9 
 
 
395 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  34.17 
 
 
399 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  31.87 
 
 
389 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  31.52 
 
 
395 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.05 
 
 
398 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  33.16 
 
 
395 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4093  protein of unknown function UPF0027  46.02 
 
 
482 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  31.5 
 
 
406 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  32.2 
 
 
399 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  30.47 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.03 
 
 
407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  32.1 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.89 
 
 
408 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  31.83 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3106  protein of unknown function UPF0027  44.25 
 
 
480 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  32.28 
 
 
393 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  29.92 
 
 
384 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  32.91 
 
 
407 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.26 
 
 
402 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1132  protein of unknown function UPF0027  44.89 
 
 
482 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  31.17 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  29.95 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  31.61 
 
 
405 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  31.61 
 
 
405 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.28 
 
 
404 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  32.72 
 
 
478 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.1 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  29 
 
 
398 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  30.53 
 
 
428 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  31.14 
 
 
410 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  30.15 
 
 
398 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.15 
 
 
401 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  29.87 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  30.13 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  28.38 
 
 
398 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  30.05 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.1 
 
 
408 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  28.57 
 
 
406 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.11 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  30.3 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.3 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.62 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.84 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.84 
 
 
408 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.84 
 
 
408 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.12 
 
 
430 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  29.84 
 
 
408 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.84 
 
 
408 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.58 
 
 
408 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.58 
 
 
408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.29 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  32.25 
 
 
463 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.32 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  29.31 
 
 
406 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  30.39 
 
 
412 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  31.3 
 
 
473 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  26.82 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.64 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.5 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  29.26 
 
 
409 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  29.18 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  33.61 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  29.74 
 
 
462 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  32.4 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  31.95 
 
 
475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  30.2 
 
 
715 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  30.2 
 
 
715 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  30.03 
 
 
484 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  31.69 
 
 
440 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>