218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1411 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  77.47 
 
 		 395 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 395 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  74.81 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  72.66 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  71.03 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  65.66 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  65.91 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  65.51 
 
 		 402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  65.4 
 
 		 384 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  64.44 
 
 		 409 aa  494  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  59.95 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  59.85 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  57.95 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  58.5 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  51.74 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  51.49 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  51.49 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  52.91 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  51.87 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  53.15 
 
 		 411 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  53.15 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  51.88 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  53.65 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  53.42 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  52.78 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  52.78 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  48.62 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  51.39 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  51.65 
 
 		 409 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  51.74 
 
 		 408 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  52.01 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  48.04 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  52.27 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  50.51 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  50.76 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  50.13 
 
 		 411 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  50.73 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  48.28 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  47.79 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  47.79 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  50.99 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  51.36 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  47.79 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  49.62 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  48.04 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  47.79 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  47.79 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  47.55 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  50.26 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  50.24 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  50.74 
 
 		 404 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  50.25 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  47.52 
 
 		 405 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  47.77 
 
 		 405 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  47.28 
 
 		 405 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  49.49 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  50.77 
 
 		 715 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  50.77 
 
 		 715 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  49.34 
 
 		 389 aa  312  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  46.75 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  45.27 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  46.65 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  47.09 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  45.34 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  38.27 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  39.58 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  35.61 
 
 		 462 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  39.8 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  34.96 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  35.01 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  36.64 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  33.08 
 
 		 473 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  31.14 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  30.88 
 
 		 447 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  34.27 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  32.71 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  36.08 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  31.58 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  33.16 
 
 		 470 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  29.86 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  36.86 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  35.05 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  34.64 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  31.68 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  32.99 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  31.29 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  30.35 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  29.82 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  29.5 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  29.01 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  34.97 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2099  protein of unknown function UPF0027  28.1 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  29.32 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  29.32 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  32.9 
 
 		 369 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  33.26 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  32.04 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>