209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1375 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1375  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 
405 aa  832    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0018523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  39.51 
 
 
395 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  39.01 
 
 
395 aa  272  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  38.77 
 
 
395 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  38.77 
 
 
395 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  38.77 
 
 
395 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  39.8 
 
 
391 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  42.61 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2099  protein of unknown function UPF0027  40.14 
 
 
421 aa  269  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  38.52 
 
 
395 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  38.52 
 
 
395 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  38.82 
 
 
400 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  39.26 
 
 
379 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  39.37 
 
 
375 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  35.56 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  33.83 
 
 
371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2963  hypothetical protein  38.37 
 
 
349 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3237  gp160  38.58 
 
 
319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0158  protein of unknown function UPF0027  34.69 
 
 
387 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4093  protein of unknown function UPF0027  32.67 
 
 
482 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3106  protein of unknown function UPF0027  30.02 
 
 
480 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1132  protein of unknown function UPF0027  29.79 
 
 
482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  30 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  29.26 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  29.84 
 
 
407 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  29.36 
 
 
398 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.83 
 
 
393 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  29.08 
 
 
399 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  29.27 
 
 
384 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  29.83 
 
 
398 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  30.77 
 
 
393 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  30.33 
 
 
406 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  29.47 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.77 
 
 
402 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  30.43 
 
 
395 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.08 
 
 
404 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  31.88 
 
 
393 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.23 
 
 
405 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  27.86 
 
 
398 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  29.23 
 
 
405 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  28.14 
 
 
410 aa  149  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  28.79 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  28.75 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.69 
 
 
395 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  29.53 
 
 
394 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  29.87 
 
 
397 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  27.49 
 
 
404 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  27.49 
 
 
401 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  30.36 
 
 
395 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  28.57 
 
 
408 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.08 
 
 
398 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.04 
 
 
409 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  30.35 
 
 
410 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  27.86 
 
 
409 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.47 
 
 
408 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.47 
 
 
408 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  29.4 
 
 
408 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.4 
 
 
408 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  26.92 
 
 
409 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  28.19 
 
 
408 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.4 
 
 
408 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  27.82 
 
 
385 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  28.57 
 
 
428 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  30.17 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.15 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  27.19 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.5 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  29.01 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  28.09 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  27.18 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  29.11 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  26.97 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  27.18 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  28.39 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  27.48 
 
 
406 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  28.09 
 
 
388 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  28.68 
 
 
430 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  28.89 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  28.14 
 
 
409 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  27.81 
 
 
407 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  27.81 
 
 
407 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  28.95 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  27.81 
 
 
407 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  28.54 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  27.53 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  25.83 
 
 
384 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  28.57 
 
 
715 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  28.57 
 
 
715 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  27.74 
 
 
396 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  28.87 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  28.09 
 
 
463 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  25.63 
 
 
440 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  27.86 
 
 
508 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  26.88 
 
 
478 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  22.9 
 
 
466 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  26.51 
 
 
439 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  26.65 
 
 
473 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  26.72 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  23.02 
 
 
466 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>