218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5225 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  82.75 
 
 		 406 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  76.06 
 
 		 409 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  78.16 
 
 		 411 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  87.03 
 
 		 409 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  78.16 
 
 		 428 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  75.56 
 
 		 411 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  78.66 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  78.91 
 
 		 407 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  97.52 
 
 		 404 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  78.66 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  86.53 
 
 		 401 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  75.31 
 
 		 407 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  76.35 
 
 		 411 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  87.41 
 
 		 408 aa  744    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  78.16 
 
 		 407 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  837    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  70.74 
 
 		 405 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  70.48 
 
 		 405 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  70.28 
 
 		 408 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  70.53 
 
 		 408 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  70.74 
 
 		 405 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  70.28 
 
 		 408 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  70.28 
 
 		 408 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  70.12 
 
 		 407 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  70.28 
 
 		 408 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  70.28 
 
 		 408 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  70.28 
 
 		 408 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  69.46 
 
 		 412 aa  591  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  69.77 
 
 		 408 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  70.28 
 
 		 408 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  70.05 
 
 		 410 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  67 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  65.01 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  66.5 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  60.2 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  58.71 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  57.29 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  56.03 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  54.91 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  53.96 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  53.57 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  52.48 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  52.53 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  52.87 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  49.63 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  48.08 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  50.25 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  48.51 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  47.77 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  50.66 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  49.13 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  48.05 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  50.13 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  49.87 
 
 		 389 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  49.39 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  46.77 
 
 		 410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  48.03 
 
 		 388 aa  342  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  48.74 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  49.1 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  45.43 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  47.4 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  44.69 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  49.1 
 
 		 715 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  49.1 
 
 		 715 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  39.2 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  33.08 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  34.91 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  35.19 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.94 
 
 		 470 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  34.77 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  35.46 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.92 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  35.55 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  32.18 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  33.73 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  32.65 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.21 
 
 		 484 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  30.35 
 
 		 498 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  32.64 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  29.79 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  30.97 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  31.08 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  31.98 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  31.93 
 
 		 488 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  30.22 
 
 		 484 aa  159  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  29.81 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  29.81 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  29.88 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  31.96 
 
 		 473 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  29.88 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  29.88 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  31.01 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.64 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  30.99 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  31.31 
 
 		 474 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  29.61 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  30.19 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  31.96 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  31.19 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>