218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4745 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  70.06 
 
 		 475 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  68.72 
 
 		 470 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  976    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  51.07 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  50.11 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  49.41 
 
 		 512 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  52.47 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  51.2 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  47.21 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  44.73 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  42.48 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  42.06 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  38.84 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  35.7 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  33.17 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  34.49 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  36.25 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  32.04 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  34.03 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  35.11 
 
 		 411 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  34.94 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  37.44 
 
 		 410 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  35.62 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  35.11 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  35.34 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  34.61 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  34.59 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  34.17 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  35.1 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  35.29 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  36.86 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  34.95 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  35.1 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  35.52 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  35.52 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  34.23 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  33.08 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  34.91 
 
 		 404 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  35.06 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  35.06 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  35.06 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  35.06 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  35.06 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  34.83 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  35.06 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  34.63 
 
 		 395 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  35.38 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  35.66 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  35.14 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  35.88 
 
 		 408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  34.09 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  36.46 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  34.86 
 
 		 407 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  36.63 
 
 		 406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  34.57 
 
 		 408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  38.21 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  34.86 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  34.32 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  34.57 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  34.35 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  33.76 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  34.11 
 
 		 409 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  34.91 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  34.13 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  34.92 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  34.16 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  32.82 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  36.68 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  33.58 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  32.85 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  31.5 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  32.55 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  33.42 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  32.18 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1051  hypothetical protein  28.04 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.738167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  32.48 
 
 		 394 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  35.32 
 
 		 384 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  32.99 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  33.41 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  33.16 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  33.77 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  31.75 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  38.97 
 
 		 715 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  38.97 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  31.25 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  32.86 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1011  hypothetical protein  29.31 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  32.51 
 
 		 407 aa  153  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  32.39 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  31.77 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  35.45 
 
 		 375 aa  140  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  31.98 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  32.12 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  28.92 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  30.48 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  28.71 
 
 		 480 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  29.41 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>